zoukankan      html  css  js  c++  java
  • ceRNA 调控机制

    ceRNA 不同于mRNA, lncRNA, ncRNA 等概念,其指的既不是某一种类型的RNA(比如mRNA, lncRNA), 也不是某一类的RNA(如ncRNA);

    ceRNA 其实指的是不同种类的RNA之间的调控机制,英文名为 competing endogenous RNA , 翻译成中文叫做 " 竞争性内源RNA ";

    在这个概念中有两个关键词,竞争和内源, 内源指的是这个调控机制本来在生物体内就存在,而竞争就是这个调控机制的核心;

    对于miRNA, 研究的都很成熟,其通过和mRNA的3'UTR 进行结合,抑制mRNA的翻译或者导致mRNA降解,实现转录后的调控基因表达的功能;

    在miRNA和 mRNA 结合的机制中,有一个概念叫做 MREs (microRNA response elements), 中文名叫做 miRNA 应答元件,正是由于mRNA上存在相关的MREs, 所以才能够和miRNA进行结合;

    对于lncRNA, circRNA 等其他类型的RNA, 也存在MREs ,对于某些 假基因来说,其转录本由于和祖先基因的高同源性,也存在MREs, 这就导致在生物体内,对于同一个miRNA来说,mRNA, lncRNA, circRNA, pseudogene-mRNA 都会来结合这个miRNA, mRNA, lncRNA, circRNA 这三者之间就存在了一个竞争关系, 通过竞争性的结合miRNA, 形成了一个复杂的调控网络,从而调控基因的表达;

    那么ceRNA机制如何来调控基因的表达量呢?如下图所示,RNA X 和 RNA Y 都有相同的MREs, 竞争性的结合同种类型的miRNA

    An external file that holds a picture, illustration, etc.
Object name is nihms315843f2.jpg

    假设细胞内该miRNA 一共只有4个,在正常的表达情况下,RNA X 结合1个miRNA, RNA Y 结合2个miRNA,

    当RNA Y表达量降低时,RNA X 结合3个miRNA,  RNA Y 结合1个miRNA;

    当RNA Y表达量提高时,RNA X 结合1个miRNA,  RNA Y 结合3个miRNA;

    由于miRNA对表达量起一个负调控作用,当RNA Y 表达量降低时,RNA X与更多的miRNA结合,导致RNA X的表达量也相应降低,当RNA Y 表达量提高时, 与RNA X 结合的miRNA 变少,RNA X的表达量也相应提高;

    参考文献: A ceRNA hypothesis: the Rosetta stone of a hidden RNA language ?

  • 相关阅读:
    HDFS文件系统上传时序图 PB级文件存储时序图
    HDFS 文件系统流程图。PB级文件存储时序图。
    HBase 1.1.2 优化插入 Region预分配
    InputStream、OutputStream
    StringBuffer_StringBuilder
    java中的字符串
    升级的三个因素
    装饰设计模式
    IO字符流之读写缓冲区(BufferedWriter、BufferedReader)
    IO(FileWriter/FileReader)字符流:文件的写入、续写、读
  • 原文地址:https://www.cnblogs.com/xudongliang/p/6794844.html
Copyright © 2011-2022 走看看