Mongodb用于存储非结构化数据，尤其擅长存储json格式的数据。存储的量大概在10亿级别，再往上性能就下降了，除非另外分库。Hbase是架构在hdfs上的列式存储，擅长rowkey的快速查询，但模糊匹配查询（其实是前模糊或全模糊）不擅长，但存储的量可以达到百亿甚至以上，比mongodb的存储量大多了。
总结：MongoDB更像传统的关系型数据库，更善于做查询。Hbase更偏向非关系型数据库，扩展储存能力强