这个问题困扰我好几天了，虽然说整改前段，有iis帮忙，但是毕竟不能用vs调试有点不习惯。
哎，今天本来都想重做系统，最后抱着试试看的心情，试了最后一把，没有想到还正解决了。
解决步骤如下：
重新打补丁以后，还是不行，重新安装iis，然后注册iis以后还是不行，我汗，最后终于解决了，现在将解决的答案贴在这里。
Vs2008 Debug时出现的错误，不能开始项目，系统找不到指定的文件
原因：安装Vs其他版本的时候需要修改IIS的参数配置
解决方案：
关闭Vs2008
1、regedit
2、local_machiche--software-miscrosoft-windows-curr version -app-Paths 找到iexplore.exe删掉，然后重新添加
3、右击app-Paths， 添加项 iexplore.exe 默认值为：C://Program Files//Internet Explorer//iexplore.exe 添加字符串值：path ： 值为：C://Program Files//Internet Explorer
重启Vs2008，ok。