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  • numpy(3)矩阵运算和文件存取

    1.矩阵运算

    矩阵的乘积可以使用dot函数进行计算。

    对于二维数组,它计算的是矩阵乘积,对于一维数组,它计算的是其点积。当需要将一维数组当作列矢量或者行矢量进行矩阵运算时,推荐先使用reshape函数将一维数组转换为二维数组:

    >>> a = array([1, 2, 3])
    >>> a.reshape((-1,1))
    array([[1],
           [2],
           [3]])
    >>> a.reshape((1,-1))
    array([[1, 2, 3]])

    2.文件存取

    NumPy提供了多种文件操作函数方便我们存取数组内容。文件存取的格式分为两类:二进制和文本。而二进制格式的文件又分为NumPy专用的格式化二进制类型和无格式类型。

    使用数组的方法函数tofile可以方便地将数组中数据以二进制的格式写进文件。tofile输出的数据没有格式,因此用numpy.fromfile读回来的时候需要自己格式化数据:

    >>> a = np.arange(0,12)
    >>> a.shape = 3,4
    >>> a
    array([[ 0,  1,  2,  3],
           [ 4,  5,  6,  7],
           [ 8,  9, 10, 11]])
    >>> a.tofile("a.bin")
    >>> b = np.fromfile("a.bin", dtype=np.float) # 按照float类型读入数据
    >>> b # 读入的数据是错误的
    array([  2.12199579e-314,   6.36598737e-314,   1.06099790e-313,
             1.48539705e-313,   1.90979621e-313,   2.33419537e-313])
    >>> a.dtype # 查看a的dtype
    dtype('int32')
    >>> b = np.fromfile("a.bin", dtype=np.int32) # 按照int32类型读入数据
    >>> b # 数据是一维的
    array([ 0,  1,  2,  3,  4,  5,  6,  7,  8,  9, 10, 11])
    >>> b.shape = 3, 4 # 按照a的shape修改b的shape
    >>> b # 这次终于正确了
    array([[ 0,  1,  2,  3],
           [ 4,  5,  6,  7],
           [ 8,  9, 10, 11]])

    从上面的例子可以看出,需要在读入的时候设置正确的dtype和shape才能保证数据一致。并且tofile函数不管数组的排列顺序是C语言格式的还是Fortran语言格式的,统一使用C语言格式输出。

    此外如果fromfile和tofile函数调用时指定了sep关键字参数的话,数组将以文本格式输入输出。

    numpy.load和numpy.save函数以NumPy专用的二进制类型保存数据,这两个函数会自动处理元素类型和shape等信息,使用它们读写数组就方便多了,但是numpy.save输出的文件很难和其它语言编写的程序读入:

    >>> np.save("a.npy", a)
    >>> c = np.load( "a.npy" )
    >>> c
    array([[ 0,  1,  2,  3],
           [ 4,  5,  6,  7],
           [ 8,  9, 10, 11]])

    如果你想将多个数组保存到一个文件中的话,可以使用numpy.savez函数。savez函数的第一个参数是文件名,其后的参数都是需要保存的数组,也可以使用关键字参数为数组起一个名字,非关键字参数传递的数组会自动起名为arr_0, arr_1, ...。savez函数输出的是一个压缩文件(扩展名为npz),其中每个文件都是一个save函数保存的npy文件,文件名对应于数组名。load函数自动识别npz文件,并且返回一个类似于字典的对象,可以通过数组名作为关键字获取数组的内容:

    >>> a = np.array([[1,2,3],[4,5,6]])
    >>> b = np.arange(0, 1.0, 0.1)
    >>> c = np.sin(b)
    >>> np.savez("result.npz", a, b, sin_array = c)
    >>> r = np.load("result.npz")
    >>> r["arr_0"] # 数组a
    array([[1, 2, 3],
           [4, 5, 6]])
    >>> r["arr_1"] # 数组b
    array([ 0. ,  0.1,  0.2,  0.3,  0.4,  0.5,  0.6,  0.7,  0.8,  0.9])
    >>> r["sin_array"] # 数组c
    array([ 0.        ,  0.09983342,  0.19866933,  0.29552021,  0.38941834,
            0.47942554,  0.56464247,  0.64421769,  0.71735609,  0.78332691])

    如果你用解压软件打开result.npz文件的话,会发现其中有三个文件:arr_0.npy, arr_1.npy, sin_array.npy,其中分别保存着数组a, b, c的内容。

    使用numpy.savetxt和numpy.loadtxt可以读写1维和2维的数组:

    >>> a = np.arange(0,12,0.5).reshape(4,-1)
    >>> np.savetxt("a.txt", a) # 缺省按照'%.18e'格式保存数据,以空格分隔
    >>> np.loadtxt("a.txt")
    array([[  0. ,   0.5,   1. ,   1.5,   2. ,   2.5],
           [  3. ,   3.5,   4. ,   4.5,   5. ,   5.5],
           [  6. ,   6.5,   7. ,   7.5,   8. ,   8.5],
           [  9. ,   9.5,  10. ,  10.5,  11. ,  11.5]])
    >>> np.savetxt("a.txt", a, fmt="%d", delimiter=",") #改为保存为整数,以逗号分隔
    >>> np.loadtxt("a.txt",delimiter=",") # 读入的时候也需要指定逗号分隔
    array([[  0.,   0.,   1.,   1.,   2.,   2.],
           [  3.,   3.,   4.,   4.,   5.,   5.],
           [  6.,   6.,   7.,   7.,   8.,   8.],
           [  9.,   9.,  10.,  10.,  11.,  11.]])

    文件名和文件对象

    本节介绍所举的例子都是传递的文件名,也可以传递已经打开的文件对象,例如对于load和save函数来说,如果使用文件对象的话,可以将多个数组储存到一个npy文件中:

    >>> a = np.arange(8)
    >>> b = np.add.accumulate(a)
    >>> c = a + b
    >>> f = file("result.npy", "wb")
    >>> np.save(f, a) # 顺序将a,b,c保存进文件对象f
    >>> np.save(f, b)
    >>> np.save(f, c)
    >>> f.close()
    >>> f = file("result.npy", "rb")
    >>> np.load(f) # 顺序从文件对象f中读取内容
    array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7])
    >>> np.load(f)
    array([ 0,  1,  3,  6, 10, 15, 21, 28])
    >>> np.load(f)
    array([ 0,  2,  5,  9, 14, 20, 27, 35])
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