代谢组学分析

• 综述文章
• 标准数据
• 流程样例 & 实用工具
  • MetaboAnalyst的多组学分析
    • 代谢组学数据质量评估
    • 主成分分析（PCA）
    • PLS-DA/OPLS-DA二维图
    • 数据归一化分析
    • 单变量统计分析
    • 差异代谢产物聚类分析
    • KEGG差异代谢产物通路分析
  • 程序

综述文章

【代谢组学】3.数据分析
https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/12116920.html

【代谢组学】4.生物标志物分析
https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/12142441.html

非靶向代谢组学数据分析方法总结
https://blog.csdn.net/fjsd155/article/details/89685075

标准数据

流程样例 & 实用工具

质谱原始数据出发，进行峰对齐、保留时间校正和峰面积提取。代谢物结构鉴定采用精确质量数匹配（<25 ppm）和二级谱图匹配的方式，检索METLIN数据库和 HMDB 数据库；两组比较时，删除两组组内缺失值均>50%的离子峰；接着对数据进行归一化（采用 autoscaling或UV法）。百泰派克应用 MetaboAnalysis、SIMCA-P软件进行多维统计分析和单维统计分析，包括PCA、PLS-DA、OPLS-DA、以及通路富集分析，确保提供全面精准的代谢组学分析结果。

MetaboAnalyst的多组学分析

http://www.biotech-pack.com/metabolomics-bioinformatics.html
https://mp.weixin.qq.com/s/XThAKeSBriHbeYKlU96pmA

代谢组学数据质量评估

主成分分析（PCA）

PLS-DA/OPLS-DA二维图

数据归一化分析

单变量统计分析

差异代谢产物聚类分析

KEGG差异代谢产物通路分析

程序

<代码>
<说明>