【1】准备工作：
下载最新版本的eclipse。下载地址：http://www.eclipse.org/downloads/
下载最新版本的JDK。下载地址：http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/index.html
下载Android SDK。下载之后找个地方解压之后即可使用。下载地址：http://androidappdocs.appspot.com/sdk/index.html
安装Eclipse ADT 插件，有两种安装方式：
1.在线安装，将Eclipse解压之后，选择菜单help->Software Updates。在Available Software tab页里点击add site按钮，输入https://dl-ssl.google.com/Android/eclipse。然后Install就OK了。
2.离线安装，下载ADT插件包之后（下载地址：http://androidappdocs.appspot.com/sdk/eclipse-adt.html ），安装方式1的方法安装即可。区别在于点击add site 按钮之后输入本地ADT插件包的地址即可。
下载Android NDK。下载之后找个地方解压之后即可使用。下载地址：http://androidappdocs.appspot.com/sdk/ndk/index.html
Eclipse 能够为包括 C 语言在内的任何语言的开发提供支持。一个名为 CDT 的插件，使得在 Eclipse 里能对C/C++ 进行开发。CDT插件的下载地址： http://www.eclipse.org/cdt/
要想进行Android JNI开发，Windows操作系统下还需要安装 Cygwin ，并安装上重要的包（特别是 GCC 和Make ）。Cygwin的下载地址：http://www.cygwin.com/
接下来是windows 下面的配置：
在晕的死下可以配置 eclipse ， ndk ， cygwin ，使得可以在 eclipse 中直接对 android 项目中编写 c/c++ 代码并且自动编译，就像写 java 代码一样方便（当然，其实没有写 java 代码方便啦，写 java 代码可是有代码提醒功能的），当然，这个配置并不如在linux 下配置简单。 前提条件：首先要确保cygwin 安装好了且可以运行，建议将devel 下面的所有包都装上，谁知道那个什么时候要用上呢。
1. 在 cygwin 中设置环境变量
打开C:/cygwin/home/tao/.bash_profile 文件（假设cygwin 是安装在C:/cygwin 目录），在最后添加以下内容：ANDROID_NDK_ROOT=/cygdrive/d/android-ndk-r5b export ANDROID_NDK_ROOT
保存后退出；
【2】集成NDK
准备工作之后，这时你的Eclipse已经有了CDT插件了，你可以在Eclipse里编译JNI工程了。
生成项目也是快速而灵活的。你曾经使用过 Eclipse 的生成器吗？它们是一些可配置的开关，用于执行你所配置的命令和刷新工程资源。以下是我的配置：
右击你的项目，选择“ properties ”
在左边的列表中选择“ Builders ”
在右侧，点击“ New… ”按钮
在列表框，选择“ Program ”作为配置类型；点击“ OK ”按钮，进入下一个配置对话框。
命名 name 为“ Native Builder ”
选择 Location 为“ c:/cygwin/bin/bash.exe ”
“ Working Directory ”为“ c:/cygwin/bin ”
“ Arguments ”为：
重点是arguments ：
--login -c "cd /cygdrive/d/workspace/hello-jni&&$ANDROID_NDK_ROOT/ndk-build"
这条命令的意思是：在cygwin 环境下进入你的android 项目的目录里面，执行ndk 的ndk-build 命令编译c 代码。 相当于在linux 环境中打开命令行终端，进入你的android 项目再用ndk 的ndk-build 编译c 代码。 其实，cygwin 就是对linux 环境的一个模拟，这也是为什么在晕的死的环境下搭建这个环境这么麻烦的原因了。 Cd /cygdrive/d/workspace/hello-jni 命令的作用就是进入windows 文件结构下的d 盘下的workspace/hello-jni 目录，也就是你eclipse 中android 项目的绝对路径，而$ANDROID_NDK_ROOT 就是在第一步中配置的环境变量，指向ndk 跟目录，这条命令的意思就是执行ndk-build 程序编译c 代码了，编译完了以后会在android 项目的libs 目录下生成一个.so 文件。
确保在 login 前有两个连接号， -c 后面的引号。
接着打开“ refresh ”的 tab 面板：
选中“ Refresh resources upon completion ”
选择“ Specific resources ”
点击“ Specify resources ”按钮，选择你项目的 lib 目录
选中“ Recursively include sub-folders ”
接着打开“ Build Options ”的 tab 面板：
选中“ Allocate Console ”
选中“ Launch in background ”
选中“ Run the builder After a Clean ”
选中“ Run the builder During manual builds ”
选中“ Run the builder During auto builds ”
选中“ Specify working set of relevant resources ”
点击“ Specify Resources ”按钮，选择你项目的 JNI 目录，并包含所有的文件。
点击“ OK ”按钮。
这里假设： cygwin 安装在 c:/cygwin ； NDK 安装在 c:/Android_NDK ；项目工程名称是“ myapp ”。根据你的安装配置，相应地替换这些参数。 你刚刚做了什么呢？你使得，在 JNI 的目录下，每次修改任何文件， Eclipse 都通过 cygwin 自动启动 NDK 编译你的工程，并在控制台输出编译信息。当它编译完成，将自动刷新工程输出目录（lib ），并触发 ADT 生成一个新的 APK 安装包。这一切都极其简便。