原文:https://blog.csdn.net/du_shuang/article/details/84111250
热图(heatmap)是数据分析的常用方法,通过色差、亮度来展示数据的差异、易于理解。Python在Matplotlib库中,调用imshow()函数实现热图绘制。
参考资料:http://matplotlib.org/users/image_tutorial.html
源码介绍如下图所示:
imshow(X, cmap=None, norm=None, aspect=None, interpolation=None, alpha=None, vmin=None, vmax=None, origin=None, extent=None, shape=None, filternorm=1, filterrad=4.0, imlim=None, resample=None, url=None, hold=None, data=None, **kwargs)
其中,X变量存储图像,可以是浮点型数组、unit8数组以及PIL图像,如果其为数组,则需满足一下形状:
(1) M*N 此时数组必须为浮点型,其中值为该坐标的灰度;
(2) M*N*3 RGB(浮点型或者unit8类型)
(3) M*N*4 RGBA(浮点型或者unit8类型)
下面这段代码是一个简单的实例:
# coding=utf-8 from matplotlib import pyplot as plt X = [[1,2],[3,4],[5,6]] plt.imshow(X) plt.show()
输出如下图所示:
Colorbar:增加颜色类标的代码是plt.colorbar(),代码如下:
#coding=utf-8 from matplotlib import pyplot as plt X = [[1,2],[3,4],[5,6]] plt.imshow(X) plt.colorbar() plt.show()
运行结果如下图所示,其中左上角颜色为蓝色,对应值为1;右下角颜色为深红色,对应值为6。它是按照矩阵X进行颜色分布的。
[1, 2] [深蓝, 浅蓝]
[3, 4] [淡绿, 黄色]
[5, 6] [橙红, 深红]
plt.colorbar(cax=None,ax=None,shrink=0.5)可设置Bar为一半长度。
Colormap:参数cmap用于设置热图的Colormap。(参考百度百科)
Colormap是MATLAB里面用来设定和获取当前色图的函数,可以设置如下色图:
hot 从黑平滑过度到红、橙色和黄色的背景色,然后到白色。
cool 包含青绿色和品红色的阴影色。从青绿色平滑变化到品红色。
gray 返回线性灰度色图。
bone 具有较高的蓝色成分的灰度色图。该色图用于对灰度图添加电子的视图。
white 全白的单色色图。
spring 包含品红和黄的阴影颜色。
summer 包含绿和黄的阴影颜色。
autumn 从红色平滑变化到橙色,然后到黄色。
winter 包含蓝和绿的阴影色。
下面这段代码是显示原图、灰度(gray)、和春夏秋冬的示例。
#coding=utf-8 from matplotlib import pyplot as plt X = [[1,2],[3,4]] fig = plt.figure() ax = fig.add_subplot(231) ax.imshow(X) ax = fig.add_subplot(232) ax.imshow(X, cmap=plt.cm.gray) #灰度 ax = fig.add_subplot(233) im = ax.imshow(X, cmap=plt.cm.spring) #春 plt.colorbar(im) ax = fig.add_subplot(234) im = ax.imshow(X, cmap=plt.cm.summer) plt.colorbar(im, cax=None, ax=None, shrink=0.5) #长度为半 ax = fig.add_subplot(235) im = ax.imshow(X, cmap=plt.cm.autumn) plt.colorbar(im, shrink=0.5, ticks=[-1,0,1]) ax = fig.add_subplot(236) im = ax.imshow(X, cmap=plt.cm.winter) plt.colorbar(im, shrink=0.5) plt.show()
运行结果如下图所示:
通常图片都是由RGB组成,一块一块的,详见我的数字图像处理系列博客,这里想把某块显示成一种颜色,则需要调用interpolation='nearest'参数即可,代码如下:
#coding=utf-8 from matplotlib import pyplot as plt X = [[0, 0.25], [0.5, 0.75]] fig = plt.figure() ax = fig.add_subplot(121) im = ax.imshow(X, cmap=plt.get_cmap('hot')) plt.colorbar(im, shrink=0.5) ax = fig.add_subplot(122) im = ax.imshow(X, cmap=plt.get_cmap('hot'), interpolation='nearest', vmin=0, vmax=1) plt.colorbar(im, shrink=0.2) plt.show()
运行结果如下图所示:
推荐文章:matplotlib imshow - default colour normalisation
默认情况下,imshow将数据标准化为最小和最大值。 您可以使用vmin和vmax参数或norm参数来控制(如果您想要非线性缩放)。
百度经验提供一段代码,也不错,推荐大家学习。
注意:相当于在A~J和a~j的图像矩阵中,产生10*10的随机数,对矩阵进行颜色填充;只是在填充过程中,选择随机数的最大值和最小值进行标准化处理。
# coding=utf-8 import numpy as np from matplotlib import pyplot as plt from matplotlib import cm from matplotlib import axes def draw_heatmap(data,xlabels,ylabels): #cmap=cm.Blues cmap=cm.get_cmap('rainbow',1000) figure=plt.figure(facecolor='w') ax=figure.add_subplot(1,1,1,position=[0.1,0.15,0.8,0.8]) ax.set_yticks(range(len(ylabels))) ax.set_yticklabels(ylabels) ax.set_xticks(range(len(xlabels))) ax.set_xticklabels(xlabels) vmax=data[0][0] vmin=data[0][0] for i in data: for j in i: if j>vmax: vmax=j if j<vmin: vmin=j map=ax.imshow(data,interpolation='nearest',cmap=cmap,aspect='auto',vmin=vmin,vmax=vmax) cb=plt.colorbar(mappable=map,cax=None,ax=None,shrink=0.5) plt.show() a=np.random.rand(10,10) print a xlabels=['A','B','C','D','E','F','G','H','I','J'] ylabels=['a','b','c','d','e','f','g','h','i','j'] draw_heatmap(a,xlabels,ylabels)
运行结果如下图所示:
最后希望这篇文章对你有所帮助,该篇文章的重点知识不是画图,而是后续的研究:
1.如何通过热图来描绘人类动力学兴趣转换点;
2.图像处理感兴趣的同学,会通过imshow()处理相关知识;
3.用热图颜色表示差异,体现矩阵数据的关注点。
同时推荐大家阅读电子科技大学,赵志丹老师的博士论文《人类行为时空特性的分析建模及动力学研究》,下一篇文章我将简单讲述人类时空分析及结合Python绘图简单介绍。因为最近研究这方面知识,希望对你有所帮助,如果文章存在错误或不足之处,还请海涵。
真的好忙啊,都没时间做很多自己喜欢的事情,写文也是,但每当想起你,我这张丑脸上总会泛起微笑。加油,秀璋。娜娜,晚安!