Mysql 数据库的文件包括：
1、参数文件：my.cnf
2、日志文件，包括错误日志、查询日志、慢查询日志、二进制日志
3、Mysql表文件：用来存放mysql表结构的文件，一般以.frm为后缀
4、Socket文件：当用unix域套接字方式进行连接时需要的文件
5、Pid文件：mysql实例的进程ID文件
6、存储引擎文件：每个存储引擎都有自己的文件夹来保存各种数据，这些存储引擎真正存储了数据和索引等数据。
参数文件
可以通过命令行“mysql --help | grep my.cnf”查看my.cnf文件的位置；
Mysql在启动时可以不需要参数文件，但是如果在默认的数据库目录下找不到mysql架构，则启动会失败；
Mysql的参数可以通过“show variables”来查看，由于从mysql5.1版本开始，可以通过information_schema架构下的GLOBAL_VARIABLES视图来进行查找，所以也可以这样查看
“select * from information_schema.global_variables”；
Mysql 的参数类型：分为动态（dynamic）和静态参数（static），动态参数意味着可以再mysql实例运行中进行更改；静态参数说明在整个实例声明周期内都不得进行更改，就好像是只读的。在动态参数中，有些参数修改可以是基于回话的也可以是基于整个实例的生命周期。Mysql5.1的动态参数在这里。
Mysql表文件
不论采用何种搜索引擎，mysql都有一个以frm为后缀名的文件，这个文件记录了该表的表结构定义文件。值得注意的是，frm还可以用来存放视图的定义。
Socket文件
通过使用命令“show variables like ‘socket’;”查看socket文件的目录
Pid 文件
当mysql实例启动时，会将自己的进程ID写入一个文件中，该文件即为pid文件，文件名为主机名.pid，通过命令“show variables like ‘pid_file’;”来查看。
日志文件
1、错误日志，该文件对mysql的启动、运行、关闭过程进行了记录，在遇到问题时，首先应该查看此文件，可以通过“show variables like ‘log_error’;”来定位该文件。
2、慢查询日志，该文件记录了所有运行时间超过阀值的SQL语句，该阀值可以通过参数long_query_time来设置。默认值为10秒。
但是在默认情况下，mysql并不启动满查询日志，需要手工修改这个参数；
需要注意的两点内容：首先，慢查询日志记录的是大于阀值的SQL语句，而不是大于等于！！！其次，从mysql5.1开始，long_quey_time开始以微秒记录sql语句运行时间。
另一个和慢查询相关的参数是log_queries_not_using_index，如果运行的SQL语句没有使用索引，则mysql则同样会将这条SQL语句记录到慢查询日志文件中；
在慢查询日志文件逐渐增大时，可考虑使用工具mysqldumpslow工具帮助我们分析。
该工具的使用您可以使用 “man mysqldumpslow” 或者去这里了解。
Mysql5.1开始可以将慢查询的日志记录放入一张表中，该表在mysql.slow_log表中。
是否放在表中由参数‘log_output’来决定；参数log_output指定了慢查询输出的格式，默认为FILE,也可以将其设置为TABLE，就可以去Mysql.slow_log中去查询了。
同样也可以将查询日志的记录放入mysql架构下的general_log表。
3、查询日志
查询日志记录了所有对Mysql数据库请求的信息。
4、二进制日志
因为二进制日志太重要了，在这里暂且不提。
InnoDB存储引擎文件
这些文件包括表空间文件和重做日志文件。表空间的介绍请看Mysql InnoDB存储结构总结，重做日志也很重要，在这里暂且不提。