1、/bin目录
bin是binary（二进制）的缩写。这个目录沿袭了UNIX系统的结构，存放着使用者最经常使用的二进制可执行命令。例如cp、ls、cat，等等。
2、/boot目录
这里存放的是启动Linux时使用的一些核心文件。/boot目录存放引导加载器(bootstrap loader)使用的文件，如lilo，核心映像也经常放在这里， 而不是放在根目录中。但是如果有许多核心映像，这个目录就可能变得很大，这时使用单独的文件系统会更好一些。还有一点要注意的是，要确保核心映像必须在i d e硬盘的前1024柱面内。
3、/dev目录
dev是device（设备）的缩写。这个目录下是所有Linux的外部设备文件（即设备驱动程序），其功能类似DOS下的.sys和Win下的.vxd。在Linux中设备和文件是用同种方法访问的。例如：/dev/hda代表第一个物理IDE硬盘。
/dev 目录包括所有设备的设备文件。设备文件用特定的约定命名，这在设备列表中说明。
设备文件在安装时由系统产生，以后可以用/dev/makedev 描述。/dev/makedev.local 是系统管理员为本地设备文件(或连接)写的描述文稿(即如一些非标准设备驱动不是标准 makedev 的一部分)。
(1) /dev/console 系统控制台，也就是直接和系统连接的监视器。
(2) /dev/hd ide硬盘驱动程序接口。如： /dev/hda指的是第一个硬盘， had1则是指/dev/hda的第一个分区。如系统中有其他的硬盘，则依次为/dev/hdb、/dev/hdc、. . . ；如有多个分区则依次为hda1、hda2 . . .
(3) /dev/sd scsi磁盘驱动程序接口。如有系统有scsi硬盘，就不会访问/dev/hda，而会访问/dev/sda。
(4) /dev/fd 软驱设备驱动程序。如： /dev/fd0指系统的第一个软盘，也就是通常所说的A：盘，/dev/fd1指第二个软盘，. . . . . .而/dev/fd1 h1440则表示访问驱动器1中的4 . 5高密盘。
(5) /dev/st scsi磁带驱动器驱动程序。
(6) /dev/tty 提供虚拟控制台支持。如： /dev/tty1指的是系统的第一个虚拟控制台， /dev/tty2则是系统的第二个虚拟控制台。
(7) /dev/pty 提供远程登陆伪终端支持。在进行telnet登录时就要用到/dev/pty设备。
(8) /dev/ttys 计算机串行接口，对于dos来说就是“ com1”口。
(9) /dev/cua 计算机串行接口，与调制解调器一起使用的设备。
(10) /dev/null “黑洞”，所有写入该设备的信息都将消失。例如：当想要将屏幕上的输出信息隐藏起来时，只要将输出信息输入到/dev/null中即可。
4、/etc目录
存放系统管理所需要的配置文件和子目录。
(1) /etc/rc 或 /etc/rc.d 或 /etc/rc?.d 启动、或改变运行级时运行的配置文件、脚本或脚本的目录
(2) /etc/passwd 用户数据库，其中的域给出了用户名、真实姓名、用户起始目录、加密口令和用户的其他信息。
(3) /etc/fdprm 软盘参数表，用以说明不同的软盘格式。可用setfdprm 进行设置。更多的信息见setfdprm的帮助页。
(4) /etc/fstab 指定启动时需要自动安装的文件系统列表。也包括用swapon -a启用的s w a p区的信息。
(5) /etc/group 类似/etc/passwd ，但说明的不是用户信息而是组的信息。包括组的各种数据。
(6) /etc/inittab init 的配置文件。
(7) /etc/issue 包括用户在登录提示符前的输出信息。通常包括系统的一段短说明或欢迎信息。具体内容由系统管理员确定。
(8) /etc/magic “file”的配置文件。包含不同文件格式的说明，“file”基于它猜测文件类型。
(9) /etc/motd motd是message of the day的缩写，用户成功登录后自动输出。内容由系统管理员确定。常用于通告信息，如计划关机时间的警告等。
(10) /etc/mtab 当前安装的文件系统列表。由脚本(scritp)初始化，并由mount 命令自动更新。当需要一个当前安装的文件系统的列表时使用(例如df命令)。
(11) /etc/shadow 在安装了影子(shadow)口令软件的系统上的影子口令文件。影子口令文件将/etc/passwd文件中的加密口令移动到/etc/shadow中，而后者只对超级用户(root)可读。这使破译口令更困难，以此增加系统的安全性。
(12) /etc/login.defs login命令的配置文件。
(13) /etc/printcap 类似/etc/termcap ，但针对打印机。语法不同。
(14) /etc/profile 、/etc/csh.login、/etc/csh.cshrc 登录或启动时bourne或c shells执行的文件。这允许系统管理员为所有用户建立全局缺省环境。
(15) /etc/securetty 确认安全终端，即哪个终端允许超级用户( root )登录。一般只列出虚拟控制台，这样就不可能(至少很困难)通过调制解调器( modem )或网络闯入系统并得到超级用户特权。
(16) /etc/shells 列出可以使用的shell。chsh 命令允许用户在本文件指定范围内改变登录的shell。提供一台机器ftp服务的服务进程ftpd 检查用户shell是否列在/etc/shells 文件中，如果不是，将不允许该用户登录。
(17) /etc/termcap 终端性能数据库。说明不同的终端用什么“转义序列”控制。写程序时不直接输出转义序列(这样只能工作于特定品牌的终端)，而是从/etc/termcap 中查找要做的工作的正确序列。这样，多数的程序可以在多数终端上运行。
5、/home目录
用户的主目录，比如说有个用户叫wang，那他的主目录就是/home/wang也可以用~wang表示。
6、/lib目录
这个目录里存放着系统最基本的动态链接共享库，其作用类似于Windows里的.dll文件。几乎所有的应用程序都须要用到这些共享库。
/lib/modules 目录包含系统核心可加载各种模块，尤其是那些在恢复损坏的系统时重新引导系统所需的模块(例如网络和文件系统驱动)。
7、/lost+found
这个目录平时是空的，当系统不正常关机后，这里就成了一些无家可归的文件的避难所。对了，有点类似于DOS下的.chk文件。
8、/mnt目录
这个目录是空的，系统提供这个目录是让用户临时挂载别的文件系统。
9、/proc目录
这是一个虚拟的目录，它是系统内存的映射，通过直接访问这个目录可以获取系统信息。它并不存在于某个磁盘上，而是由核心在内存中产生，也就是说，这个目录的内容不在硬盘上而是在内存里。下面说明一些最重要的文件和目录(/proc 文件系统在proc man页中有更详细的说明)。 /proc的东西都是Linux系统所需要加载的系统数据，而且是挂载在内存当中的，所以没有占用任何的硬盘空间。
(1) /proc/x 关于进程x的信息目录，这一x是这一进程的标识号。每个进程在/proc 下有一个名为自己进程号的目录。
(2) /proc/cpuinfo 存放处理器( cpu )的信息，如cpu的类型、制造商、型号和性能等。
(3) /proc/devices 当前运行的核心配置的设备驱动的列表。
(4) /proc/dma 显示当前使用的dma通道。
(5) /proc/filesystems 核心配置的文件系统信息。
(6) /proc/interrupts 显示被占用的中断信息和占用者的信息，以及被占用的数量。
(7) /proc/ioports 当前使用的i/o端口。
(8) /proc/kcore 系统物理内存映像。与物理内存大小完全一样，然而实际上没有占用这么多内存；它仅仅是在程序访问它时才被创建。(注意：除非你把它拷贝到什么地方，否则/proc 下没有任何东西占用任何磁盘空间。)
(9) /proc/kmsg 核心输出的消息。也会被送到syslog。
(10) /proc/ksyms 核心符号表。
(11) /proc/loadavg 系统“平均负载”；3个没有意义的指示器指出系统当前的工作量。
(12) /proc/meminfo 各种存储器使用信息，包括物理内存和交换分区( swap )。
(13) /proc/modules 存放当前加载了哪些核心模块信息。
(14) /proc/net 网络协议状态信息。
(15) /proc/self 存放到查看/proc 的程序的进程目录的符号连接。当2个进程查看/proc 时，这将会是不同的连接。这主要便于程序得到它自己的进程目录。
(16) /proc/stat 系统的不同状态，例如，系统启动后页面发生错误的次数。
(17) /proc/uptime 系统启动的时间长度。
(18) /proc/version 核心版本。
10、/root目录
系统管理员的主目录。作为系统的拥有者，总要有些特权啊！比如单独拥有一个目录。
11、/sbin目录
s就是Super User的意思，也就是说这里存放的是系统管理员使用的管理程序。凡是目录sbin中包含的都是root权限才能执行的。
12、/tmp目录
存放一些临时文件程序在运行时产生的数据。但在引导启动后，运行的程序最好使用/var/tmp 来替代 /tmp，因为前者可能拥有一个更大的磁盘空间。
13、/var目录
/var 包含系统一般运行时要改变的数据。通常这些数据所在的目录的大小是要经常变化或扩充的。原来/var目录中有些内容是在/usr中的，但为了保持/usr目录的相对稳定，就把那些需要经常改变的目录放到/var中了。每个系统是特定的，即不通过网络与其他计算机共享。 也是某些大文件的溢出区。
(1) /var/catman 包括了格式化过的帮助( man )页。帮助页的源文件一般存在/usr/man/man中；有些man页可能有预格式化的版本，存在/usr/man/cat中。而其他的man页在第一次看时都需要格式化，格式化完的版本存在/var/man 中，这样其他人再看相同的页时就无须等待格式化了。 (/var/catman 经常被清除，就像清除临时目录一样。)
(2) /var/lib 存放系统正常运行时要改变的文件。
(3) /var/local 存放/usr/local 中安装的程序的可变数据(即系统管理员安装的程序)。注意，如果必要，即使本地安装的程序也会使用其他/var 目录，例如/var/lock 。
(4) /var/lock 锁定文件。许多程序遵循在/var/lock 中产生一个锁定文件的约定，以用来支持他们正在使用某个特定的设备或文件。其他程序注意到这个锁定文件时，就不会再使用这个设备或文件。
(5) /var/log 各种程序的日志(log)文件，尤其是login (/var/log/wtmp log纪录所有到系统的登录和注销) 和syslog (/var/log/messages 纪录存储所有核心和系统程序信息)。/var/log里的文件经常不确定地增长，应该定期清除。
(6) /var/run 保存在下一次系统引导前有效的关于系统的信息文件。例如， /var/run/utmp 包含当前登录的用户的信息。
(7) /var/spool 放置“假脱机( spool )”程序的目录，如mail、news、打印队列和其他队列工作的目录。每个不同的spool在/var/spool 下有自己的子目录，例如，用户的邮箱就存放在/var/spool/mail 中。
(8) /var/tmp 比/tmp 允许更大的或需要存在较长时间的临时文件。注意系统管理员可能不允许/var/tmp 有很旧的文件。
14、/usr目录
这是最庞大的目录，我们要用到的应用程序和文件几乎都存放在这个目录下。其中包含以下子目录；
(1) /usr/X11R6 存放X-Window的目录；
(2) /usr/bin 集中了几乎所有用户命令，是系统的软件库。另有些命令在/bin 或/usr/local/bin 中。
(3) /usr/sbin 包括了根文件系统不必要的系统管理命令，例如多数服务程序。
(4) /usr/man 、/usr/doc 、/usr/info 这些目录包含所有手册页、gnu信息文档和各种其他文档文件。每个联机手册的“节”都有两个子目录。例如： /usr/man/man1中包含联机手册第一节的源码(没有格式化的原始文件)，/usr/man/cat1包含第一节已格式化的内容。l联机手册分为以下九节：内部命令、系统调用、库函数、设备、文件格式、游戏、宏软件包、系统管理和核心程序。
(5) /usr/include 包含了Linux下开发和编译应用程序需要的c语言头文件，这些文件多以.h结尾，用来描述C语言程序中用到的数据结构、子过程和常量。为了保持一致性，这实际上应该放在/usr/lib 下，但习惯上一直沿用了这个名字。
(6) /usr/lib 名字lib来源于库(library)，存放一些常用的动态链接共享库和静态档案库。包含了程序或子系统的不变的数据文件，包括一些site-wide配置文件。编程的原始库也存在/usr/lib 里。当编译程序时，程序便会和其中的库进行连接。也有许多程序把配置文件存入其中。
(7) /usr/local 这是提供给一般用户的/usr目录，在这里安装软件最适合；
/usr/local/bin 本地增加的命令
/usr/local/lib 本地增加的库
(8) /usr/src Linux开放的源代码就存在这个目录。
注意：/etc、/bin、/dev、/lib、/sbin这五个目录必须与根目录在同一个磁盘分区！