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  • Toward the bloodborne miRNome of human diseases

    德国多个研究机构的研究人员绘制了来自病人血液的miRNA表达谱,其中包括自体免疫疾病、癌症、心血管疾病以及慢性炎症患者。该研究成果发表在9月4日的《自然—方法学》(Nature Methods)在线版上。

    在一项多中心研究中,研究人员对患病个体的454个血液样本进行芯片分析,确定了863个microRNA的表达谱,并利用实时定量PCR验证了此miRNA组(miRNome)。他们检测了所有疾病的一致下调图谱,而通路分析证实了各个miRNA的疾病相关性。他们还发现,疾病相关遗传变异的基因组位置与下调的miRNA存在显著相关性(P = 0.004)。

    miRNA不仅影响或者调控了细胞增殖、分化过程中的mRNA和关键蛋白质,还可能同时具有肿瘤抑制因子和原癌基因的功能,在癌症的诊断和治疗中发挥重要的作用。尽管大部分报道的miRNA表达谱都是从实体组织中产生的,但越来越多的证据表明,miRNA表达谱也可以从体液中轻松获取,比如血液。

    于是,德国生物标志物探索中心的Andreas Keller联合其他研究人员,试图阐明并比较不同疾病中863个miRNA的血液表达谱,以检测疾病特异的改变。他们收集了454个血液样本,分别来自患有肺癌、前列腺癌、胰腺癌、黑色素瘤、卵巢癌、胃癌、肾母细胞癌、胰腺肿瘤、多发性硬化症、慢性阻塞性肺疾病、结节病、牙周炎、胰腺炎或急性心肌梗塞的个体,以及未患病的对照个体。

    研究人员使用了高度特异的引物延伸型芯片,这种芯片表现出非常低的交叉杂交,可区分let-7家族的成员。平均说来,他们在每种疾病中找到103个下调的miRNA。与对照相比,总共62个miRNA在至少6种疾病中下调,而24个miRNA在一半以上疾病中下调。一个miRNA(hsa-miR-320d)在11种疾病中下调,而三个miRNA在9种疾病中下调。大部分miNRA在多数疾病中一致下调。

    为了研究显著下调的miRNA是否在物理位置上接近已知的易感变异体,他们提取了3495个发表的SNP,并在这些SNP周围的250 kb范围内搜索miRNA的编码序列。他们检测到241个SNP与miRNA接近的情况。其中,7个与研究中包含的疾病相关。他们发现,遗传变异的邻近与下调的miRNA存在显著相关性(P = 0.004)。

    作者总结道,鉴定疾病与血细胞中miRNA表达谱变化之间的复杂关系,不仅有助于了解疾病关联,还为病理过程提供了线索,因为miRNA影响了数千个基因的表达。(生物谷 Bioon.com)

    http://www.nature.com/nmeth/journal/v8/n10/full/nmeth.1682.html

    Toward the blood-borne miRNome of human diseases
    Nature Methods
    Volume: 8,
    Pages: 841–843
    Year published: (2011)
    DOI: doi:10.1038/nmeth.1682
    Received 09 May 2011 Accepted 27 July 2011 Published online 04 September 2011

    In a multicenter study, we determined the expression profiles of 863 microRNAs by array analysis of 454 blood samples from human individuals with different cancers or noncancer diseases, and validated this 'miRNome' by quantitative real-time PCR. We detected consistently deregulated profiles for all tested diseases; pathway analysis confirmed disease association of the respective microRNAs. We observed significant correlations (P = 0.004) between the genomic location of disease-associated genetic variants and deregulated microRNAs.

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  • 原文地址:https://www.cnblogs.com/emanlee/p/2283545.html
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