流形学习(Manifold Learning)是机器学习中一大类算法的统称,流形学习是非线性的降维方法(an approach to non-linear dimensionality reduction)。PCA、LDA等降维方法基于线性假设,经常会损失数据内部非线性的结构信息;流形学习是线性降维方法的generalization,目的是捕获数据内部非线性的结构。而MDS就是流行学习中非常经典的一种方法。
多维尺度变换是一种在低维空间展示“距离”数据结构的多元数据分析技术,是一种将多维空间的研究对象简化到低维空间进行定位、分析和归类,同时又保留对象间原始关系的数据分析方法。多维尺度变换算法集中于保留高维空间中的“相似度”信息,而在一般的问题解决的过程中,这个“相似度”通常用欧式距离来定义。
通俗来讲,就是将多维数据映射到低维空间,同时保持各个样本之间的原有相对距离不变。
多维尺度变换的目标:当n 个对象中各对对象之间的相似性(或距离)给定时,确定这些对象在低维(欧式) 空间中的表示(称为感知图, Perceptual Mapping),
并使其尽可能与原先的相似性(或距离)“大体匹配”,使得由降维所引起的任何变形达到最小。
多维尺度变换可以应用到数据可视化,通过可视化找出异常点,反欺诈应用等。
计算步骤大致如下:
第一步:计算所有数据项两两间的实际距离(可参考皮尔逊算法或欧几里德算法)
第二步:将数据项随机放置在二维图上。
第三步:针对每两两构成的一对数据项,将它们的实际距离与当前在二维图上的距离进行比较,求出一个误差值
第四步:根据误差的情况,按照比例将每个数据项的所在位置移近或移远少许量。(每一个节点的移动,都是所有其它节点施加在该节点上的推或拉的结合效应。)
第五步:重复第三步、第四步(节点每移动一次,其当前距离与实际距离的差距就会减少一些)。这一过程会不断地重复多次,直到无法再通过移动节点来减少总体误差为止。
python 实现
已知四个城市之间的距离,如何展示出他们的相对位置,原理就是利用MDS将多维数据映射到二维空间,作为经纬度坐标,同时之间的相对距离保持不变。
import numpy as np import pandas as pd from sklearn.manifold import MDS import matplotlib.pyplot as plt #%% data = np.array([(0,1046,608,1859), (1046,0,825,1149), (608,825,0,1280), (1859,1149,1280,0) ] ) index = ['beijing','shanghai','zhengzhou','guangzhou'] columns = ['beijing','shanghai','zhengzhou','guangzhou'] Word = pd.DataFrame(data,index,columns) Word #%% mds = MDS() mds.fit(data) #%% a = mds.embedding_ print(a) plt.scatter(a[0:,0],a[0:,1],color='red')