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POJO = pure old java object or plain ordinary java object or what ever.
PO = persisent object 持久对象
就是说在一些Object/Relation Mapping工具中，能够做到维护数据库表记录的persisent object完全是一个符合Java Bean规范的纯Java对象，没有增加别的属性和方法。全都是这样子的：
public class User {
private long id;
private String name;
public void setId(long id); {
this.id = id;
}
public void setName(String name); {
this.name=name;
}
public long getId(); {
return id;
}
public String getName(); {
return name;
}
}
首先要区别持久对象和POJO。
持久对象实际上必须对应数据库中的entity，所以和POJO有所区别。比如说POJO是由new创建，由GC回收。但是持久对象是insert数据库创建，由数据库delete删除的。基本上持久对象生命周期和数据库密切相关。另外持久对象往往只能存在一个数据库Connection之中，Connnection关闭以后，持久对象就不存在了，而POJO只要不被GC回收，总是存在的。
由于存在诸多差别，因此持久对象PO(Persistent Object)在代码上肯定和POJO不同，起码PO相对于POJO会增加一些用来管理数据库entity状态的属性和方法。而ORM追求的目标就是要PO在使用上尽量和POJO一致，对于程序员来说，他们可以把PO当做POJO来用，而感觉不到PO的存在。
JDO的实现方法是这样的：
1、编写POJO
2、编译POJO
3、使用JDO的一个专门工具，叫做Enhancer，一般是一个命令行程序，手工运行，或者在ant脚本里面运行，对POJO的class文件处理一下，把POJO替换成同名的PO。
4、在运行期运行的实际上是PO，而不是POJO。
该方法有点类似于JSP，JSP也是在编译期被转换成Servlet来运行的，在运行期实际上运行的是Servlet，而不是JSP。
Hibernate的实现方法比较先进：
1、编写POJO
2、编译POJO
3、直接运行，在运行期，由Hibernate的CGLIB动态把POJO转换为PO。
由此可以看出Hibernate是在运行期把POJO的字节码转换为PO的，而JDO是在编译期转换的。一般认为JDO的方式效率会稍高，毕竟是编译期转换嘛。但是Hibernate的作者Gavin King说CGLIB的效率非常之高，运行期的PO的字节码生成速度非常之快，效率损失几乎可以忽略不计。
实际上运行期生成PO的好处非常大，这样对于程序员来说，是无法接触到PO的，PO对他们来说完全透明。可以更加自由的以POJO的概念操纵PO。另外由于是运行期生成PO，所以可以支持增量编译，增量调试。而JDO则无法做到这一点。实际上已经有很多人在抱怨JDO的编译期Enhancer问题了，而据说JBossDO将采用运行期生成PO字节码，而不采用编译期生成PO字节码。
另外一个相关的问题是，不同的JDO产品的Enhancer生成的PO字节码可能会有所不同，可能会影响在JDO产品之间的可移植性，这一点有点类似EJB的可移植性难题。
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由这个问题另外引出一个JDO的缺陷。
由于JDO的PO状态管理方式，所以当你在程序里面get/set的时候，实际上不是从PO的实例中取values，而是从JDO StateManager中取出来，所以一旦PM关闭，PO就不能进行存取了。
在JDO中，也可以通过一些办法使得PO可以在PM外面使用，比如说定义PO是transient的，但是该PO在PM关闭后就没有PO identity了。无法进行跨PM的状态管理。
而Hibernate是从PO实例中取values的，所以即使Session关闭，也一样可以get/set，可以进行跨Session的状态管理。
在分多层的应用中，由于持久层和业务层和web层都是分开的，此时Hibernate的PO完全可以当做一个POJO来用，也就是当做一个VO，在各层间自由传递，而不用去管Session是开还是关。如果你把这个POJO序列化的话，甚至可以用在分布式环境中。（不适合lazy loading的情况）
但是JDO的PO在PM关闭后就不能再用了，所以必须在PM关闭前把PO拷贝一份VO，把VO传递给业务层和web层使用。在非分布式环境中，也可以使用ThreadLocal模式确保PM始终是打开状态，来避免每次必须进行PO到VO的拷贝操作。但是不管怎么说，这总是权宜之计，不如Hibernate的功能强。