Database
每个Database(DB)由一个.ns文件及若干个数据文件组成
$ll mydb.* -rw------- 1 ydzhang staff 67108864 7 4 14:05 mydb.0 -rw------- 1 ydzhang staff 16777216 7 4 14:05 mydb.ns
数据文件从0开始编号，依次为mydb.0、mydb.1、mydb.2等，文件大小从64MB起，依次倍增（1倍），最大为2GB。
Namespace
每个DB包含多个namespace（对应mongodb的collection名），mydb.ns实际上是一个hash表（采用线性探测方式解决冲突），用于快速定位某个namespace的起始位置。
hash表里的一个节点包含的元数据结构如下，每个节点大小为628Bytes，16M的NS文件最多可存储26715个namespace。
1 Node { 2 int hash; 3 Namespace key; 4 NamespaceDetails value; 5 };
- key为namespace的名字，为固定长度128字节的字符数组。
- hash为namespce的hash值，用于快速查找
- value包含一个namespace所有的元数据
namespace元数据结构如下:
1 class NamespaceDetails { 2 3 DiskLoc firstExtent;// 第一个extent位置 4 DiskLoc lastExtent;// 最后一个extent位置 5 6 DiskLoc deletedListSmall[SmallBuckets];//不同大小的删除记录 7 8 int nIndexes; 9 10 IndexDetails _indexes[NIndexesBase];//索引 11 12 //...... 13 }
其中DiskLoc代表某个数据文件的具体偏移位置，数据文件使用mmap映射到内存空间进行管理，内存的管理（哪些数据何时换入/换出）完全交给OS管理。
1 DiskLoc { 2 int _a; // 数据文件编号，如mydb.0编号为0 3 int ofs; // 文件内部偏移 4 };
数据文件
每个数据文件被划分成多个extent，每个extent只包含一个namespace的数据，同一个namespace的所有extent之间以双向链表形式组织。
namesapce的元数据里包含指向第一个及最后一个extent的位置指针，通过这些信息，就可以遍历一个namespace的所有extent数据。
每个数据文件包含一个固定长度头部DataFileHeader
1 DataFileHeader { 2 DataFileVersion version; 3 int fileLength; 4 DiskLoc unused; 5 int unusedLength; 6 DiskLoc freeListStart; 7 DiskLoc freeListEnd; 8 char reserve[]; 9 };
Header中包含数据文件版本、文件大小、未使用空间位置及长度、空闲extent链表起始及结束位置。extent被回收时（compact），就会放到数据文件对应的空闲extent链表里。
unusedLength为数据文件未被使用过的空间长度，unused则指向未使用空间的起始位置。
Extent
每个extent包含多个Record（对应mongodb的document）,同一个extent下的所有record以双向链表形式组织。
1 // 用于检查extent数据有效性 2 DiskLoc myLoc; // extent自身位置 3 4 /* 前一个/后一个 extent位置指针 */ 5 DiskLoc xnext; 6 DiskLoc xprev; 7 8 int length; // extent总长度 9 10 DiskLoc firstRecord; // extent内第一个record位置指针 11 DiskLoc lastRecord; // extent内最后一个record位置指针 12 char _extentData[4]; // extent数据 13 };
Record
每个Record对应mongodb里的一个文档，每个Record包含固定长度16bytes的描述信息。
1 class Record { 2 int _lengthWithHeaders; // Record长度 3 int _extentOfs; // Record所在的extent位置指针 4 int _nextOfs; // 前一个Record位置信息 5 int _prevOfs; // 后一个Record位置信息 6 char _data[4]; // Record数据 7 };
Record被删除后，会以DeleteRecord的形式存储，其前两个字段与Record是一致的。
1 class DeletedRecord { 2 int _lengthWithHeaders; // record长度 3 int _extentOfs; // record所在的extent位置指针 4 DiskLoc _nextDeleted; // 下一个已删除记录的位置 5 }；
一个namespace下的所有的已删除记录（可以回收并复用的存储空间）以单向链表的形式，为了最大化存储空间利用率，不同size（32B、64B、128B…）的记录被挂在不同的链表上，NamespaceDetail里的deletedListSmall/deletedListLarge包含指向这些不同大小链表头部的指针。
写入Record
- 检查对应的namespace对应的删除记录链表里是否有合适的DeletedRecord可以利用，如果有，则直接复用删除空间写入记录。
- 检查数据文件的freeList里是否有合适大小的空闲extent可以利用，如果有则直接利用空闲的extent，将记录写入。
- 第1、2步都不成功，则写创建新的extent写入记录；创建新extent时，如果当前的数据文件没有足够的空闲空间，则创建新的数据文件。
删除Record
删除的记录会以DeleteRecord的形式插入到对应集合的删除链表里，删除的空间在下一次写入新的记录时可能会被利用上；但也有可能一直用不上而浪费。比如某个128Bytes大小的记录被删除后，接下来写入的记录一直大于128B，则这个128B的DeletedRecord不能有效的被利用。
当删除很多时，可能产生很多不能重复利用的”存储碎片”，从而导致存储空间大量浪费；可通过对集合进行compact来整理存储碎片。
更新Record
更新Record时，分2种情况
- 更新的Record比原来小，可以直接复用现有的空间（原地更新）；多余的空间如果足够多，会将剩余空间插入到DeletedRecord链表；
- 更新的Record比原来大，更新相当于删除 + 新写入，原来的空间会插入到DeletedRecord链表里。
更新跟删除类似，也有可能产生很多存储碎片；如果业务场景里更新很多，可通过合理设置Record Padding，尽量让每次更新都直接复用现有存储空间。
查询Record
没有索引的情况下，查询某个Record需要遍历整个集合，读取出符合条件的Record；如果经常需要根据每个纬度查询Record，则需要给集合建立索引以提高查询效率。
一个Collection的逻辑结构
Namespace=CollectionNamespace+IndexNamespace
CollectionNamespace=FreeSpaceList+ExtentList(一个数据文件内可以包含多条ExtentList，因为一个数据文件可以包含多个Namespace的数据)
Extent=DocumentRecordList
IndexNamespace=B-tree
参考：http://www.mongoing.com/archives/1484
http://www.cnblogs.com/purpleraintear/p/6035115.html