简单记录下，如有必要，将深入补充：
一、非root用户运行Tomcat及原因
由于项目中，为了安全需要，Tomcat将禁止以root形式启动，原因很简单，举个例子，一旦有人恶意将jsp文件透过某个别的漏洞传到你的服务器中，那么你的程序运行过程中，将会远端被别人恶意执行代码，轻则服务器被黑，重则通过这台跳板进入你的后台，病毒式的入侵到内网的其他机器（例如大量的Redis以及MongoDB置于内网时是不设置密码的），所以以非root的方式启动Tomcat对于商用的环境下，是必须的。
默认的情况下，Linux中的Tomcat都由bin目录下的catalina.sh执行，那么Tomcat的启动用户就由有权限启动Tomcat的运行命令的人：
./catalina.sh start
如果希望是非root用户启动，可以通过递归改变文件主以及文件所属的组获得执行权限
chown -R user1 ./apache-tomcat-xxx
即如果是以root权限启动的Tomcat服务，使用如下命令：
ps -ef|grep tomcat
查看到你的Tomcat以什么权限启动的,看到启动主为红线标注角色：
那么下面我使用非root用户启动下：
二、非root用户文件操作被禁止
我的问题是Web项目所有的一切功能正常使用，但是在一处与SpringMVC的MultipartFile文件接收的Controller报错如下：
Processing of multipart/form-data request failed. /usr/local/apache-tomcat-9.0.4/work/Catalina/localhost/EDoctor/upload_50259820_2122_4f77_af6d_17f1fd261a13_00000001.tmp (Permission denied)
以及在出错堆栈的打印中看到Permission denied和IOException其实本能想到是权限的问题，由于可以使用非root用户运行tomcat，但是现在重点是，Tomcat中存放tmp中间文件的目录到底在哪里？
三、解决方法
其实Tomcat中有一个work目录，其作用的话主要有下面两点：
- jsp运行时都要先转换成servlet，tomcat容器启动时会在目录下的work目录中生成一系列的文件夹和.java文件和编译后的.class文件。
- jsp最终转化为servlet，work的作用就是加快速度，如果jsp没有变化（依据时间戳）就不再重新编译。
可以看到大概意思是work是Tomcat的工作目录，一般我们注重权限以为是webapp目录下的权限问题，其实还有一个权限就是真正的中间文件生成的工作目录：
/usr/local/apache-tomcat-9.0.4/work/Catalina/localhost/
所以只需要将该文件的目录主修改为你想要的用户，用该用户启动Tomcat就不会出现问题了。
四、总结
那么总结一下，大概就是Tomcat的用户权限问题需要格外关注$CATALINA_HOME/work/Catalina/localhost/目录下的文件主或组的权限问题