预处理：主成分分析与白化 - 走看看

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预处理：主成分分析与白化
主成分分析

引言

主成分分析（PCA）是一种能够极大提升无监督特征学习速度的数据降维算法。更重要的是，理解PCA算法，对实现白化算法有很大的帮助，很多算法都先用白化算法作预处理步骤。

假设你使用图像来训练算法，因为图像中相邻的像素高度相关，输入数据是有一定冗余的。具体来说，假如我们正在训练的16x16灰度值图像，记为一个256维向量 $extstyle x in Re^{256}$ ，其中特征值 $extstyle x_j$ 对应每个像素的亮度值。由于相邻像素间的相关性，PCA算法可以将输入向量转换为一个维数低很多的近似向量，而且误差非常小。

实例和数学背景

在我们的实例中，使用的输入数据集表示为 $extstyle {x^{(1)}, x^{(2)}, ldots, x^{(m)}}$ ，维度 $extstyle n=2$ 即 $extstyle x^{(i)} in Re^2$ 。假设我们想把数据从2维降到1维。（在实际应用中，我们也许需要把数据从256维降到50维；在这里使用低维数据，主要是为了更好地可视化算法的行为）。下图是我们的数据集：

这些数据已经进行了预处理，使得每个特征 $extstyle x_1$ 和 $extstyle x_2$ 具有相同的均值（零）和方差。

为方便展示，根据 $extstyle x_1$ 值的大小，我们将每个点分别涂上了三种颜色之一，但该颜色并不用于算法而仅用于图解。

PCA算法将寻找一个低维空间来投影我们的数据。从下图中可以看出， $extstyle u_1$ 是数据变化的主方向，而 $extstyle u_2$ 是次方向。

也就是说，数据在 $extstyle u_1$ 方向上的变化要比在 $extstyle u_2$ 方向上大。为更形式化地找出方向 $extstyle u_1$ 和 $extstyle u_2$ ，我们首先计算出矩阵 $extstyle Sigma$ ，如下所示：

$egin{align} Sigma = frac{1}{m} sum_{i=1}^m (x^{(i)})(x^{(i)})^T. end{align}$

假设 $extstyle x$ 的均值为零，那么 $extstyle Sigma$ 就是x的协方差矩阵。（符号 $extstyle Sigma$ ，读"Sigma"，是协方差矩阵的标准符号。虽然看起来与求和符号 $sum_{i=1}^n i$ 比较像，但它们其实是两个不同的概念。）

可以证明，数据变化的主方向 $extstyle u_1$ 就是协方差矩阵 $extstyle Sigma$ 的主特征向量，而 $extstyle u_2$ 是次特征向量。

注：如果你对如何得到这个结果的具体数学推导过程感兴趣，可以参看CS229（机器学习）PCA部分的课件（链接在本页底部）。但如果仅仅是想跟上本课，可以不必如此。

你可以通过标准的数值线性代数运算软件求得特征向量（见实现说明）.我们先计算出协方差矩阵 $extstyle Sigma$ 的特征向量，按列排放，而组成矩阵 $extstyle U$ ：

$egin{align} U = egin{bmatrix} | & | & & | \ u_1 & u_2 & cdots & u_n \ | & | & & | end{bmatrix} end{align}$

此处， $extstyle u_1$ 是主特征向量（对应最大的特征值）， $extstyle u_2$ 是次特征向量。以此类推，另记 $extstyle lambda_1, lambda_2, ldots, lambda_n$ 为相应的特征值。

在本例中，向量 $extstyle u_1$ 和 $extstyle u_2$ 构成了一个新基，可以用来表示数据。令 $extstyle x in Re^2$ 为训练样本，那么 $extstyle u_1^Tx$ 就是样本点 $extstyle x$ 在维度 $extstyle u_1$ 上的投影的长度（幅值）。同样的， $extstyle u_2^Tx$ 是 $extstyle x$ 投影到 $extstyle u_2$ 维度上的幅值。

旋转数据

至此，我们可以把 $extstyle x$ 用 $extstyle (u_1, u_2)$ 基表达为：

$egin{align} x_{ m rot} = U^Tx = egin{bmatrix} u_1^Tx \ u_2^Tx end{bmatrix} end{align}$

（下标“rot”来源于单词“rotation”，意指这是原数据经过旋转（也可以说成映射）后得到的结果）

对数据集中的每个样本 $extstyle i$ 分别进行旋转： $extstyle x_{ m rot}^{(i)} = U^Tx^{(i)}$ for every $extstyle i$ ，然后把变换后的数据 $extstyle x_{ m rot}$ 显示在坐标图上，可得：

这就是把训练数据集旋转到 $extstyle u_1$ ， $extstyle u_2$ 基后的结果。一般而言，运算 $extstyle U^Tx$ 表示旋转到基 $extstyle u_1$ , $extstyle u_2$ , ..., $extstyle u_n$ 之上的训练数据。矩阵 $extstyle U$ 有正交性，即满足 $extstyle U^TU = UU^T = I$ ，所以若想将旋转后的向量 $extstyle x_{ m rot}$ 还原为原始数据 $extstyle x$ ，将其左乘矩阵 $extstyle U$ 即可： $extstyle x=U x_{ m rot}$ , 验算一下： $extstyle U x_{ m rot} = UU^T x = x$ .

数据降维

数据的主方向就是旋转数据的第一维 $extstyle x_{{ m rot},1}$ 。因此，若想把这数据降到一维，可令：

$egin{align} ilde{x}^{(i)} = x_{{ m rot},1}^{(i)} = u_1^Tx^{(i)} in Re. end{align}$

更一般的，假如想把数据 $extstyle x in Re^n$ 降到 $extstyle k$ 维表示 $extstyle ilde{x} in Re^k$ （令 $extstyle k < n$ ）,只需选取 $extstyle x_{ m rot}$ 的前 $extstyle k$ 个成分，分别对应前 $extstyle k$ 个数据变化的主方向。

PCA的另外一种解释是： $extstyle x_{ m rot}$ 是一个 $extstyle n$ 维向量，其中前几个成分可能比较大（例如，上例中大部分样本第一个成分 $extstyle x_{{ m rot},1}^{(i)} = u_1^Tx^{(i)}$ 的取值相对较大），而后面成分可能会比较小（例如，上例中大部分样本的 $extstyle x_{{ m rot},2}^{(i)} = u_2^Tx^{(i)}$ 较小）。

PCA算法做的其实就是丢弃 $extstyle x_{ m rot}$ 中后面（取值较小）的成分，就是将这些成分的值近似为零。具体的说，设 $extstyle ilde{x}$ 是 $extstyle x_{{ m rot}}$ 的近似表示，那么将 $extstyle x_{{ m rot}}$ 除了前 $extstyle k$ 个成分外，其余全赋值为零，就得到：

$egin{align} ilde{x} = egin{bmatrix} x_{{ m rot},1} \ vdots \ x_{{ m rot},k} \ 0 \ vdots \ 0 \ end{bmatrix} approx egin{bmatrix} x_{{ m rot},1} \ vdots \ x_{{ m rot},k} \ x_{{ m rot},k+1} \ vdots \ x_{{ m rot},n} end{bmatrix} = x_{ m rot} end{align}$

在本例中，可得 $extstyle ilde{x}$ 的点图如下（取 $extstyle n=2, k=1$ ）：

然而，由于上面 $extstyle ilde{x}$ 的后 $extstyle n-k$ 项均为零，没必要把这些零项保留下来。所以，我们仅用前 $extstyle k$ 个（非零）成分来定义 $extstyle k$ 维向量 $extstyle ilde{x}$ 。

这也解释了我们为什么会以 $extstyle u_1, u_2, ldots, u_n$ 为基来表示数据：要决定保留哪些成分变得很简单，只需取前 $extstyle k$ 个成分即可。这时也可以说，我们“保留了前 $extstyle k$ 个PCA（主）成分”。

还原近似数据

现在，我们得到了原始数据 $extstyle x in Re^n$ 的低维“压缩”表征量 $extstyle ilde{x} in Re^k$ ，反过来，如果给定 $extstyle ilde{x}$ ，我们应如何还原原始数据 $extstyle x$ 呢？查看以往章节以往章节可知，要转换回来，只需 $extstyle x = U x_{ m rot}$ 即可。进一步，我们把 $extstyle ilde{x}$ 看作将 $extstyle x_{ m rot}$ 的最后 $extstyle n-k$ 个元素被置0所得的近似表示，因此如果给定 $extstyle ilde{x} in Re^k$ ，可以通过在其末尾添加 $extstyle n-k$ 个0来得到对 $extstyle x_{ m rot} in Re^n$ 的近似，最后，左乘 $extstyle U$ 便可近似还原出原数据 $extstyle x$ 。具体来说，计算如下：

$egin{align} hat{x} = U egin{bmatrix} ilde{x}_1 \ vdots \ ilde{x}_k \ 0 \ vdots \ 0 end{bmatrix} = sum_{i=1}^k u_i ilde{x}_i. end{align}$

上面的等式基于先前对 $extstyle U$ 的定义。在实现时，我们实际上并不先给 $extstyle ilde{x}$ 填0然后再左乘 $extstyle U$ ，因为这意味着大量的乘0运算。我们可用 $extstyle ilde{x} in Re^k$ 来与 $extstyle U$ 的前 $extstyle k$ 列相乘，即上式中最右项，来达到同样的目的。将该算法应用于本例中的数据集，可得如下关于重构数据 $extstyle hat{x}$ 的点图：

由图可见，我们得到的是对原始数据集的一维近似重构。

在训练自动编码器或其它无监督特征学习算法时，算法运行时间将依赖于输入数据的维数。若用 $extstyle ilde{x} in Re^k$ 取代 $extstyle x$ 作为输入数据，那么算法就可使用低维数据进行训练，运行速度将显著加快。对于很多数据集来说，低维表征量 $extstyle ilde{x}$ 是原数据集的极佳近似，因此在这些场合使用PCA是很合适的，它引入的近似误差的很小，却可显著地提高你算法的运行速度。

选择主成分个数

我们该如何选择 $extstyle k$ ，即保留多少个PCA主成分？在上面这个简单的二维实验中，保留第一个成分看起来是自然的选择。对于高维数据来说，做这个决定就没那么简单：如果 $extstyle k$ 过大，数据压缩率不高，在极限情况 $extstyle k=n$ 时，等于是在使用原始数据（只是旋转投射到了不同的基）；相反地，如果 $extstyle k$ 过小，那数据的近似误差太太。

决定 $extstyle k$ 值时，我们通常会考虑不同 $extstyle k$ 值可保留的方差百分比。具体来说，如果 $extstyle k=n$ ，那么我们得到的是对数据的完美近似，也就是保留了100%的方差，即原始数据的所有变化都被保留下来；相反，如果 $extstyle k=0$ ，那等于是使用零向量来逼近输入数据，也就是只有0%的方差被保留下来。

一般而言，设 $extstyle lambda_1, lambda_2, ldots, lambda_n$ 表示 $extstyle Sigma$ 的特征值（按由大到小顺序排列），使得 $extstyle lambda_j$ 为对应于特征向量 $extstyle u_j$ 的特征值。那么如果我们保留前 $extstyle k$ 个成分，则保留的方差百分比可计算为：

$egin{align} frac{sum_{j=1}^k lambda_j}{sum_{j=1}^n lambda_j}. end{align}$

在上面简单的二维实验中， $extstyle lambda_1 = 7.29$ ， $extstyle lambda_2 = 0.69$ 。因此，如果保留 $extstyle k=1$ 个主成分，等于我们保留了 $extstyle 7.29/(7.29+0.69) = 0.913$ ，即91.3%的方差。

对保留方差的百分比进行更正式的定义已超出了本教程的范围，但很容易证明， $extstyle lambda_j = sum_{i=1}^m x_{{ m rot},j}^2$ 。因此，如果 $extstyle lambda_j approx 0$ ，则说明 $extstyle x_{{ m rot},j}$ 也就基本上接近于0，所以用0来近似它并不会产生多大损失。这也解释了为什么要保留前面的主成分（对应的 $extstyle lambda_j$ 值较大）而不是末尾的那些。这些前面的主成分 $extstyle x_{{ m rot},j}$ 变化性更大，取值也更大，如果将其设为0势必引入较大的近似误差。

以处理图像数据为例，一个惯常的经验法则是选择 $extstyle k$ 以保留99%的方差，换句话说，我们选取满足以下条件的最小 $extstyle k$ 值：

$egin{align} frac{sum_{j=1}^k lambda_j}{sum_{j=1}^n lambda_j} geq 0.99. end{align}$

对其它应用，如不介意引入稍大的误差，有时也保留90-98%的方差范围。若向他人介绍PCA算法详情，告诉他们你选择的 $extstyle k$ 保留了95%的方差，比告诉他们你保留了前120个（或任意某个数字）主成分更好理解。

对图像数据应用PCA算法

为使PCA算法能有效工作，通常我们希望所有的特征 $extstyle x_1, x_2, ldots, x_n$ 都有相似的取值范围（并且均值接近于0）。如果你曾在其它应用中使用过PCA算法，你可能知道有必要单独对每个特征做预处理，即通过估算每个特征 $extstyle x_j$ 的均值和方差，而后将其取值范围规整化为零均值和单位方差。但是，对于大部分图像类型，我们却不需要进行这样的预处理。假定我们将在自然图像上训练算法，此时特征 $extstyle x_j$ 代表的是像素 $extstyle j$ 的值。所谓“自然图像”，不严格的说，是指人或动物在他们一生中所见的那种图像。

注：通常我们选取含草木等内容的户外场景图片，然后从中随机截取小图像块（如16x16像素）来训练算法。在实践中我们发现，大多数特征学习算法对训练图片的确切类型并不敏感，所以大多数用普通照相机拍摄的图片，只要不是特别的模糊或带有非常奇怪的人工痕迹，都可以使用。

在自然图像上进行训练时，对每一个像素单独估计均值和方差意义不大，因为（理论上）图像任一部分的统计性质都应该和其它部分相同，图像的这种特性被称作平稳性（stationarity）。

具体而言，为使PCA算法正常工作，我们通常需要满足以下要求：(1)特征的均值大致为0；(2)不同特征的方差值彼此相似。对于自然图片，即使不进行方差归一化操作，条件(2)也自然满足，故而我们不再进行任何方差归一化操作（对音频数据,如声谱,或文本数据,如词袋向量，我们通常也不进行方差归一化）。实际上，PCA算法对输入数据具有缩放不变性，无论输入数据的值被如何放大（或缩小），返回的特征向量都不改变。更正式的说：如果将每个特征向量 $extstyle x$ 都乘以某个正数（即所有特征量被放大或缩小相同的倍数），PCA的输出特征向量都将不会发生变化。

既然我们不做方差归一化，唯一还需进行的规整化操作就是均值规整化，其目的是保证所有特征的均值都在0附近。根据应用，在大多数情况下，我们并不关注所输入图像的整体明亮程度。比如在对象识别任务中，图像的整体明亮程度并不会影响图像中存在的是什么物体。更为正式地说，我们对图像块的平均亮度值不感兴趣，所以可以减去这个值来进行均值规整化。

具体的步骤是，如果 $extstyle x^{(i)} in Re^{n}$ 代表16x16的图像块的亮度（灰度）值（ $extstyle n=256$ ），可用如下算法来对每幅图像进行零均值化操作：

$mu^{(i)} := frac{1}{n} sum_{j=1}^n x^{(i)}_j$

$x^{(i)}_j := x^{(i)}_j - mu^{(i)}$ , for all $extstyle j$

请注意：1）对每个输入图像块 $extstyle x^{(i)}$ 都要单独执行上面两个步骤，2）这里的 $extstyle mu^{(i)}$ 是指图像块 $extstyle x^{(i)}$ 的平均亮度值。尤其需要注意的是，这和为每个像素 $extstyle x_j$ 单独估算均值是两个完全不同的概念。

如果你处理的图像并非自然图像（比如，手写文字，或者白背景正中摆放单独物体），其他规整化操作就值得考虑了，而哪种做法最合适也取决于具体应用场合。但对自然图像而言，对每幅图像进行上述的零均值规整化，是默认而合理的处理。

白化
介绍

我们已经了解了如何使用PCA降低数据维度。在一些算法中还需要一个与之相关的预处理步骤，这个预处理过程称为白化（一些文献中也叫sphering）。举例来说，假设训练数据是图像，由于图像中相邻像素之间具有很强的相关性，所以用于训练时输入是冗余的。白化的目的就是降低输入的冗余性；更正式的说，我们希望通过白化过程使得学习算法的输入具有如下性质：(i)特征之间相关性较低；(ii)所有特征具有相同的方差。

2D 的例子

下面我们先用前文的2D例子描述白化的主要思想，然后分别介绍如何将白化与平滑和PCA相结合。

如何消除输入特征之间的相关性? 在前文计算 $extstyle x_{ m rot}^{(i)} = U^Tx^{(i)}$ 时实际上已经消除了输入特征 $extstyle x^{(i)}$ 之间的相关性。得到的新特征 $extstyle x_{ m rot}$ 的分布如下图所示：

这个数据的协方差矩阵如下：

$egin{align} egin{bmatrix} 7.29 & 0 \ 0 & 0.69 end{bmatrix}. end{align}$

(注: 严格地讲, 这部分许多关于“协方差”的陈述仅当数据均值为0时成立。下文的论述都隐式地假定这一条件成立。不过即使数据均值不为0，下文的说法仍然成立，所以你无需担心这个。)

$extstyle x_{ m rot}$ 协方差矩阵对角元素的值为 $extstyle lambda_1$ 和 $extstyle lambda_2$ 绝非偶然。并且非对角元素值为0; 因此, $extstyle x_{{ m rot},1}$ 和 $extstyle x_{{ m rot},2}$ 是不相关的, 满足我们对白化结果的第一个要求 (特征间相关性降低)。

为了使每个输入特征具有单位方差，我们可以直接使用 $extstyle 1/sqrt{lambda_i}$ 作为缩放因子来缩放每个特征 $extstyle x_{{ m rot},i}$ 。具体地，我们定义白化后的数据 $extstyle x_{{ m PCAwhite}} in Re^n$ 如下：

$egin{align} x_{{ m PCAwhite},i} = frac{x_{{ m rot},i} }{sqrt{lambda_i}}. end{align}$

绘制出 $extstyle x_{{ m PCAwhite}}$ ，我们得到:

这些数据现在的协方差矩阵为单位矩阵 $extstyle I$ 。我们说， $extstyle x_{{ m PCAwhite}}$ 是数据经过PCA白化后的版本: $extstyle x_{{ m PCAwhite}}$ 中不同的特征之间不相关并且具有单位方差。

白化与降维相结合。如果你想要得到经过白化后的数据，并且比初始输入维数更低,可以仅保留 $extstyle x_{{ m PCAwhite}}$ 中前 $extstyle k$ 个成分。当我们把PCA白化和正则化结合起来时(在稍后讨论)， $extstyle x_{{ m PCAwhite}}$ 中最后的少量成分将总是接近于0，因而舍弃这些成分不会带来很大的问题。

ZCA白化

最后要说明的是，使数据的协方差矩阵变为单位矩阵 $extstyle I$ 的方式并不唯一。具体地，如果 $extstyle R$ 是任意正交矩阵，即满足 $extstyle RR^T = R^TR = I$ (说它正交不太严格， $extstyle R$ 可以是旋转或反射矩阵), 那么 $extstyle R \,x_{ m PCAwhite}$ 仍然具有单位协方差。在ZCA白化中，令 $extstyle R = U$ 。我们定义ZCA白化的结果为：

$egin{align} x_{ m ZCAwhite} = U x_{ m PCAwhite} end{align}$

绘制 $extstyle x_{ m ZCAwhite}$ ，得到:

可以证明，对所有可能的 $extstyle R$ ，这种旋转使得 $extstyle x_{ m ZCAwhite}$ 尽可能地接近原始输入数据 $extstyle x$ 。

当使用 ZCA白化时(不同于 PCA白化)，我们通常保留数据的全部 $extstyle n$ 个维度，不尝试去降低它的维数。

正则化

实践中需要实现PCA白化或ZCA白化时，有时一些特征值 $extstyle lambda_i$ 在数值上接近于0，这样在缩放步骤时我们除以 $sqrt{lambda_i}$ 将导致除以一个接近0的值；这可能使数据上溢 (赋为大数值)或造成数值不稳定。因而在实践中，我们使用少量的正则化实现这个缩放过程，即在取平方根和倒数之前给特征值加上一个很小的常数 $extstyle epsilon$ ：

$egin{align} x_{{ m PCAwhite},i} = frac{x_{{ m rot},i} }{sqrt{lambda_i + epsilon}}. end{align}$

当 $extstyle x$ 在区间 $extstyle [-1,1]$ 上时, 一般取值为 $extstyle epsilon approx 10^{-5}$ 。

对图像来说, 这里加上 $extstyle epsilon$ ，对输入图像也有一些平滑(或低通滤波)的作用。这样处理还能消除在图像的像素信息获取过程中产生的噪声，改善学习到的特征(细节超出了本文的范围)。

ZCA 白化是一种数据预处理方法，它将数据从 $extstyle x$ 映射到 $extstyle x_{ m ZCAwhite}$ 。事实证明这也是一种生物眼睛(视网膜)处理图像的粗糙模型。具体而言，当你的眼睛感知图像时，由于一幅图像中相邻的部分在亮度上十分相关，大多数临近的“像素”在眼中被感知为相近的值。因此，如果人眼需要分别传输每个像素值（通过视觉神经）到大脑中，会非常不划算。取而代之的是，视网膜进行一个与ZCA中相似的去相关操作 (这是由视网膜上的ON-型和OFF-型光感受器细胞将光信号转变为神经信号完成的)。由此得到对输入图像的更低冗余的表示，并将它传输到大脑。

实现主成分分析和白化

在这一节里，我们将总结PCA, PCA白化和ZCA白化算法，并描述如何使用高效的线性代数库来实现它们。

首先，我们需要确保数据的均值（近似）为零。对于自然图像，我们通过减去每个图像块(patch)的均值（近似地）来达到这一目标。为此，我们计算每个图像块的均值，并从每个图像块中减去它的均值。（译注：参见PCA一章中“对图像数据应用PCA算法”一节）。Matlab实现如下：

avg = mean(x, 1); % 分别为每个图像块计算像素强度的均值。 x = x - repmat(avg, size(x, 1), 1);

下面，我们要计算 $extstyle Sigma = frac{1}{m} sum_{i=1}^m (x^{(i)})(x^{(i)})^T$ ，如果你在Matlab中实现（或者在C++, Java等中实现，但可以使用高效的线性代数库），直接求和效率很低。不过，我们可以这样一气呵成。

sigma = x * x' / size(x, 2);

（自己推导一下看看）这里，我们假设 $extstyle n$

接下来，PCA计算 $Σ 的特征向量。你可以使用Matlab的 eig 函数来计算。但是由于 Σ 是对称半正定的矩阵，用 svd 函数在数值计算上更加稳定。$

具体来说，如果你使用

[U,S,V] = svd(sigma);

那矩阵 $extstyle V$

（注意 svd 函数实际上计算的是一个矩阵的奇异值和奇异向量，就对称半正定矩阵的特殊情况来说，它们对应于特征值和特征向量，这里我们也只关心这一特例。关于奇异向量和特征向量的详细讨论超出了本文范围。）

最后，我们可以这样计算 $extstyle x_{ m rot}$ 和 $extstyle ilde{x}$ ：

xRot = U' * x; % 数据旋转后的结果。 xTilde = U(:,1:k)' * x; % 数据降维后的结果，这里k希望保留的特征向量的数目。

这以 $extstyle ilde{x} in Re^k$ 的形式给出了数据的PCA表示。顺便说一下，如果 $extstyle n$

为计算PCA白化后的数据 $extstyle x_{ m PCAwhite}$ ，可以用

xPCAwhite = diag(1./sqrt(diag(S) + epsilon)) * U' * x;

因为 $extstyle lambda_i$

最后，你也可以这样计算ZCA白化后的数据 $extstyle x_{ m ZCAwhite}$ :

xZCAwhite = U * diag(1./sqrt(diag(S) + epsilon)) * U' * x;
原链接：http://deeplearning.stanford.edu/wiki/index.php/%E4%B8%BB%E6%88%90%E5%88%86%E5%88%86%E6%9E%90
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原文地址：https://www.cnblogs.com/linyuanzhou/p/4991679.html

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