1.准备好需要自动运行的程序，比如123.exe
2.将“123.exe”拷贝到该路径下：\WINCE600\OSDesigns\S3C6410_DEMO\S3C6410_DEMO\RelDir\Samsung_SMDK6410_Release.
3.在pc上新建一个“123.txt”的文档，里面填入以下内容：10#\Windows\123.exe.之后将该文件重命名为 123.lnk
4.修改project.bib文件
FILES
; Name Path Memory
123.exe $(_FLATRELEASEDIR)\123.exe NK H
123.lnk $(_FLATRELEASEDIR)\123.lnk NK H
;Type
; -------------- --------------------------------------------- -----------
5.修改project.dat文件
Directory("\Windows\Startup"):-File("123.lnk","\Windows\123.exe")
6.修改shell.reg文件（还是在这个路径中：\WINCE600\OSDesigns\S3C6410_DEMO\S3C6410_DEMO\RelDir\Samsung_SMDK6410_Release）
[HKEY_LOCAL_MACHINE\init]
"Launch80"="123.exe"
"Depend50"=hex:14,00, 1e,00
7.最后一步Make Run-Time Image.将系统烧到开发板中
以上为整个过程，其中.bib文件全称为Binary Image Builder，其作用为指示构建系统如何构建二进制映像，指示哪些文件被打包到运行时映像中，同时只是如何王目标板上加载模块和文件。.dat文件用来指定当系统冷启动时，FileSys.exe应当如何初始化RAM文件系统结构，可通过DAT文件在Windows CE文件系统的根目录上挂接其他文件夹。