Python机器学习算法 — 朴素贝叶斯算法（Naive Bayes）

朴素贝叶斯算法 -- 简介

 朴素贝叶斯法是基于贝叶斯定理与特征条件独立假设的分类方法。最为广泛的两种分类模型是决策树模型(Decision Tree Model)和朴素贝叶斯模型（Naive Bayesian Model，NBM）。
        和决策树模型相比，朴素贝叶斯分类器(Naive Bayes Classifier,或 NBC)发源于古典数学理论，有着坚实的数学基础，以及稳定的分类效率。同时，NBC模型所需估计的参数很少，对缺失数据不太敏感，算法也比较简单。
        理论上，NBC模型与其他分类方法相比具有最小的误差率。但是实际上并非总是如此，这是因为NBC模型假设属性之间相互独立，这个假设在实际应用中往往是不成立的，这给NBC模型的正确分类带来了一定影响。

朴素贝叶斯算法 -- 步骤

算法步骤：
        1）收集数据；
        2）准备数据：需要数值型或布尔型数据。如果是文本文件，要解析成词条向量bai；
        3）分析数据：有大量特征时，用直方图分析效果更好；
        4）训练算法：计算不同的独立特征的条件概率；
        5）测试算法：计算错误率；
        6）使用算法：一个常见的朴素贝叶斯应用是文档分类。

贝叶斯定理

        条件概率就是事件 A 在另外一个事件 B 已经发生条件下的发生概率。条件概率表示为P(A|B)，读作“在 B 发生的条件下 A 发生的概率”。

        联合概率表示两个事件共同发生（数学概念上的交集）的概率。A 与 B 的联合概率表示为。

推导

        我们可以从条件概率的定义推导出贝叶斯定理。
        根据条件概率的定义，在事件 B 发生的条件下事件 A 发生的概率为：

        同样地，在事件 A 发生的条件下事件 B 发生的概率为：

        结合这两个方程式，我们可以得到：

        这个引理有时称作概率乘法规则。上式两边同除以 P(A)，若P(A)是非零的，我们可以得到贝叶斯定理:

高斯朴素贝叶斯（GaussianNB）

        在高斯朴素贝叶斯中，每个特征都是连续的，并且都呈高斯分布。高斯分布又称为正态分布。图画出来以后像一个倒挂的钟，以均值为轴对称，如下图所示：

        GaussianNB 实现了运用于分类的高斯朴素贝叶斯算法。特征的可能性(即概率)假设为高斯分布:

        参数和使用最大似然法估计。

from sklearn import datasets
iris = datasets.load_iris()

from sklearn.naive_bayes import GaussianNB
clf = GaussianNB()
clf = clf.fit(iris.data, iris.target)
y_pred=clf.predict(iris.data)
print("高斯朴素贝叶斯，样本总数： %d 错误样本数 : %d" % (iris.data.shape[0],(iris.target != y_pred).sum()))

多项分布朴素贝叶斯（MultinomialNB）

        MultinomialNB实现服从多项分布数据（multinomially）的贝叶斯算法，是一个经典的朴素贝叶斯文本分类中使用的变种（其中的数据是通常表示为词向量的数量，虽然TF-IDF向量在实际项目中表现得很好），对于每一个y来说，分布通过向量参数化，n是类别的数目（在文本分类中，表示词汇量的长度） 表示标签i出现的样本属于类别y的概率。
        该参数   是一个平滑的最大似然估计，即相对频率计数：

          表示标签i在样本集T中属于类别y的 数目
         表示在所有标签中类别y出现的数目
        先验平滑先验 α >=0表示学习样本中不存在的特征并防止在计算中概率为0，设置 α = 1被称为拉普拉斯平滑(Lapalce smoothing)，当α＜1称为利德斯通平滑(Lidstone smoothing)

from sklearn import datasets
iris = datasets.load_iris()

from sklearn.naive_bayes import MultinomialNB
clf = MultinomialNB()
clf = clf.fit(iris.data, iris.target)
y_pred=clf.predict(iris.data)
print("多项分布朴素贝叶斯，样本总数： %d 错误样本数 : %d" % (iris.data.shape[0],(iris.target != y_pred).sum()))

参数说明如下：

        alpha：浮点型可选参数，默认为1.0，其实就是添加拉普拉斯平滑，即为上述公式中的λ ，如果这个参数设置为0，就是不添加平滑；
        fit_prior：布尔型可选参数，默认为True。布尔参数fit_prior表示是否要考虑先验概率，如果是false,则所有的样本类别输出都有相同的类别先验概率。否则可以自己用第三个参数class_prior输入先验概率，或者不输入第三个参数class_prior让MultinomialNB自己从训练集样本来计算先验概率，此时的先验概率为P(Y=Ck)=mk/m。其中m为训练集样本总数量，mk为输出为第k类别的训练集样本数。
        class_prior：可选参数，默认为None。

总结如下：

fit_prior   class_prior         最终先验概率
False       填或不填没有意义        P(Y = Ck) = 1 / k
True        不填                  P(Y = Ck) = mk / m
True        填                   P(Y = Ck) = class_prior

伯努利朴素贝叶斯（BernoulliNB）

        BernoulliNB 实现了用于多重伯努利分布数据的朴素贝叶斯训练和分类算法，即有多个特征，但每个特征 都假设是一个二元 (Bernoulli, boolean) 变量。 因此，这类算法要求样本以二元值特征向量表示；如果样本含有其他类型的数据， 一个 BernoulliNB 实例会将其二值化(取决于 binarize 参数)。

        伯努利朴素贝叶斯的决策规则基于：

        与多项分布朴素贝叶斯的规则不同 伯努利朴素贝叶斯明确地惩罚类 y 中没有出现作为预测因子的特征 i ，而多项分布分布朴素贝叶斯只是简单地忽略没出现的特征。

        在文本分类的例子中，词频向量(word occurrence vectors)(而非词数向量(word count vectors))可能用于训练和用于这个分类器。 BernoulliNB 可能在一些数据集上可能表现得更好，特别是那些更短的文档。 如果时间允许，建议对两个模型都进行评估。

from sklearn import datasets
iris = datasets.load_iris()

from sklearn.naive_bayes import BernoulliNB
clf = BernoulliNB()
clf = clf.fit(iris.data, iris.target)
y_pred=clf.predict(iris.data)
print("伯努利朴素贝叶斯，样本总数： %d 错误样本数 : %d" % (iris.data.shape[0],(iris.target != y_pred).sum()))

朴素贝叶斯 -- 代码实现

对于新闻分类，属于多分类问题。我们可以使用MultinamialNB()完成我们的新闻分类问题。

import numpy as np

"""
    这个指南的目的是在一个实际任务上探索scikit-learn的主要工具，在二十个不同的主题上分析一个文本集合。
    在这一节中，可以看到：
        1、加载文本文件和类别
        2、适合机器学习的特征向量提取
        3、训练线性模型进行分类
        4、使用网格搜索策略，找到一个很好的配置的特征提取组件和分类器
"""

"""
    1、Loading the 20 newsgroups dataset 加载20个新闻组数据集
    为了获得更快的执行时间为第一个例子，我们将工作在部分数据集只有4个类别的数据集中：
"""
categories = ['alt.atheism', 'soc.religion.christian', 'comp.graphics', 'sci.med']
from sklearn.datasets import fetch_20newsgroups

twenty_train = fetch_20newsgroups(subset='train', categories=categories, shuffle=True, random_state=42)
print(twenty_train.target)
print(twenty_train.target_names)  # 训练集中类别的名字，这里只有四个类别
print(len(twenty_train.data))  # 训练集中数据的长度
print(len(twenty_train.filenames))  # 训练集文件名长度
print('-----')
print("
".join(twenty_train.data[0].split("
")[:3]))
print('-----')
print(twenty_train.target_names[twenty_train.target[0]])
print('-----')
print(twenty_train.target[:10])  # 前十个的类别
print('-----')
for t in twenty_train.target[:10]:
    print(twenty_train.target_names[t])  # 类别的名字
print('-----')
"""
    2、Extracting features from text files 从文本文件中提取特征
    为了在文本文件中使用机器学习算法，首先需要将文本内容转换为数值特征向量
"""

"""
    Bags of words 词袋
    最直接的方式就是词袋表示法
        1、为训练集的任何文档中的每个单词分配一个固定的整数ID（例如通过从字典到整型索引建立字典）
        2、对于每个文档，计算每个词出现的次数，并存储到X[i,j]中。

    词袋表示：n_features 是语料中不同单词的数量，这个数量通常大于100000.
    如果 n_samples == 10000，存储X的数组就需要10000*10000*4byte=4GB,这么大的存储在今天的计算机上是不可能实现的。
    幸运的是，X中的大多数值都是0，基于这种原因，我们说词袋是典型的高维稀疏数据集，我们可以只存储那些非0的特征向量。
    scipy.sparse 矩阵就是这种数据结构，而scikit-learn内置了这种数据结构。
"""

"""
    Tokenizing text with scikit-learn 使用scikit-learn标记文本
    文本处理、分词、过滤停用词都在这些高级组件中，能够建立特征字典并将文档转换成特征向量。
"""
from sklearn.feature_extraction.text import CountVectorizer  # sklearn中的文本特征提取组件中，导入特征向量计数函数

count_vect = CountVectorizer()  # 特征向量计数函数
X_train_counts = count_vect.fit_transform(twenty_train.data)  # 对文本进行特征向量处理
print(X_train_counts)  # 特征向量和特征标签
print(X_train_counts.shape)  # 形状
print('-----')

"""
    CountVectorizer支持计算单词或序列的N-grams，一旦合适，这个向量化就可以建立特征词典。
    在整个训练预料中，词汇中的词汇索引值与其频率有关。
"""
print(count_vect.vocabulary_.get(u'algorithm'))
print('-----')

"""
    From occurrences to frequencies 从事件到频率
    计数是一个好的开始，但是也存在一个问题：较长的文本将会比较短的文本有很高的平均计数值，即使他们所表示的话题是一样的。
    为了避免潜在的差异，它可以将文档中的每个单词出现的次数在文档的总字数的比例：这个新的特征叫做词频：tf
    tf-idf:词频-逆文档频率
"""
from sklearn.feature_extraction.text import TfidfTransformer  # sklearn中的文本特征提取组件中，导入词频统计函数

tf_transformer = TfidfTransformer(use_idf=False).fit(X_train_counts)  # 建立词频统计函数,注意这里idf=False
print(tf_transformer)  # 输出函数属性 TfidfTransformer(norm=u'l2', smooth_idf=True, sublinear_tf=False, use_idf=False)
print('-----')
X_train_tf = tf_transformer.transform(X_train_counts)  # 使用函数对文本文档进行tf-idf频率计算
print(X_train_tf)
print('-----')
print(X_train_tf.shape)
print('-----')
"""
    在上面的例子中，使用fit()方法来构建基于数据的预测器，然后使用transform()方法来将计数矩阵用tf-idf表示。
    这两个步骤可以通过跳过冗余处理，来更快的达到相同的最终结果。
    这些可以通过使用fit_transform()方法来实现：
"""
tfidf_transformer = TfidfTransformer()  # 这里使用的是tf-idf
X_train_tfidf = tfidf_transformer.fit_transform(X_train_counts)
print(X_train_tfidf)
print(X_train_tfidf.shape)
print('-----')
"""
    Training a classifier 训练一个分类器
    既然已经有了特征，就可以训练分类器来试图预测一个帖子的类别，先使用贝叶斯分类器，贝叶斯分类器提供了一个良好的基线来完成这个任务。
    scikit-learn中包括这个分类器的许多变量，最适合进行单词计数的是多项式变量。
"""
from sklearn.naive_bayes import MultinomialNB  # 使用sklearn中的贝叶斯分类器，并且加载贝叶斯分类器

# 中的MultinomialNB多项式函数
clf = MultinomialNB()  # 加载多项式函数
x_clf = clf.fit(X_train_tfidf, twenty_train.target)  # 构造基于数据的分类器
print(x_clf)  # 分类器属性：MultinomialNB(alpha=1.0, class_prior=None, fit_prior=True)
print('-----')
"""
    为了预测输入的新的文档，我们需要使用与前面相同的特征提取链进行提取特征。
    不同的是，在转换中，使用transform来代替fit_transform，因为训练集已经构造了分类器
"""
docs_new = ['God is love', 'OpenGL on the GPU is fast']  # 文档
X_new_counts = count_vect.transform(docs_new)  # 构建文档计数
X_new_tfidf = tfidf_transformer.transform(X_new_counts)  # 构建文档tfidf
predicted = clf.predict(X_new_tfidf)  # 预测文档
print(predicted)  # 预测类别 [3 1]，一个属于3类，一个属于1类
for doc, category in zip(docs_new, predicted):
    print('%r => %s' % (doc, twenty_train.target_names[category]))  # 将文档和类别名字对应起来
print('-----')
"""
    Building a pipeline 建立管道
    为了使向量转换更加简单(vectorizer => transformer => classifier)，scikit-learn提供了pipeline类来表示为一个复合分类器
"""
from sklearn.pipeline import Pipeline

text_clf = Pipeline([('vect', CountVectorizer()), ('tfidf', TfidfTransformer()), ('clf', MultinomialNB())])
text_clf = text_clf.fit(twenty_train.data, twenty_train.target)
print(text_clf)  # 构造分类器，分类器的属性
predicted = text_clf.predict(docs_new)  # 预测新文档
print(predicted)  # 获取预测值
print('-----')

"""
    分析总结：
        1、加载数据集，主要是加载训练集，用于对数据进行训练
        2、文本特征提取：
                对文本进行计数统计 CountVectorizer
                词频统计  TfidfTransformer  （先计算tf,再计算tfidf）
        3、训练分类器：
                贝叶斯多项式训练器 MultinomialNB
        4、预测文档：
                通过构造的训练器进行构造分类器，来进行文档的预测
        5、最简单的方式：
                通过使用pipeline管道形式，来讲上述所有功能通过管道来一步实现，更加简单的就可以进行预测
"""

"""
    Evaluation of the performance on the test set 测试集性能评价
    评估模型的预测精度同样容易：
"""
import numpy as np

twenty_test = fetch_20newsgroups(subset='test', categories=categories, shuffle=True, random_state=42)
docs_test = twenty_test.data
predicted = text_clf.predict(docs_test)
print(np.mean(predicted == twenty_test.target))  # 预测的值和测试值的比例，mean就是比例函数
print('-----')  # 精度已经为0.834886817577

"""
    精度已经实现了83.4%，那么使用支持向量机(SVM)是否能够做的更好呢，支持向量机(SVM)被广泛认为是最好的文本分类算法之一。
    尽管，SVM经常比贝叶斯要慢一些。
    我们可以改变学习方式，使用管道来实现分类：
"""
from sklearn.linear_model import SGDClassifier

text_clf = Pipeline(
    [('vect', CountVectorizer()), ('tfidf', TfidfTransformer()),
     ('clf', SGDClassifier(loss='hinge', penalty='l2', alpha=1e-3, n_iter=5, random_state=42))])
# _ = text_clf.fit(twenty_train.data, twenty_train.target)  # 和下面一句的意思一样，一个杠，表示本身
text_clf = text_clf.fit(twenty_train.data, twenty_train.target)
predicted = text_clf.predict(docs_test)
print(np.mean(predicted == twenty_test.target))  # 精度 0.912782956059
print('-----')
"""
    sklearn进一步提供了结果的更详细的性能分析工具：
"""
from sklearn import metrics
print(metrics.classification_report(twenty_test.target, predicted, target_names=twenty_test.target_names))
print(metrics.confusion_matrix(twenty_test.target, predicted))