都是设计网页的。
都可以添加ASP.Net文件夹
web应用程序Default.aspx显示有两个原有文件及Default.aspx.cs和Default.aspx.designer.cs；Web网站Default.aspx显示有一个原有文件Default.aspx.cs。
web应用程序有重新生成和发布两项；Web网站只有一个发布网站。
web应用程序和一般的winform没有什么区别都有引用的是命名空间等；Web网站在引用后出现一个bin文件夹那里存放dll和pdb文件。
web应用程序可以作为类库被引用；Web网站则不可以作为类库被引用。
web应用程序可以添加ASP.Net文件夹中不包括bin、App_Code；Web网站可以添加ASP.Net文件夹包括bin、App_Code。
web应用程序还可添加组件和类；Web网站则没有。
源文件虽然都是Default.aspx.cs但是web应用程序有命名空间，多了一项System.Collections空间引用。
Web应用程序在修改了页面底层的代码之后需要重新进行编译
网站不需要重新编译
网站可以添加APS文件夹，Web应用程序不可以
Web应用程序的项目会生成Dll文件
网站在发布的时候，会自动生成Dll文件，但是每次的Dll文件名都不一样