项目经理与职能经理有时候分不清他们具体的职责是什么，查找了一下，主要分如下几块：
1. 职责不同
项目经理对整个的项目负责。
职能经理对某部门负责
2. 权限不同
项目经理要比职能经理大的多。
3. 业绩考核标准不同
项目经理的个人收益都是同项目盈亏直接挂钩的。
职能经理的收益是与公司的整体收益挂钩。
4. 工作方法不用
项目经理的职权在项目实施中有效，控制的职能较弱。
职能经理的职位相对稳定，职权的较长期性使得他们在管理上可以采用一些较强的手段。
5. 根据项目管理组织结构划分
简单地说，在同时有项目和职能两条线的公司基本都是矩阵型，权利大小而已。 项目权利大，那么职能部门相当于资源池，项目经理索取资源完成项目。
职能权利大一般是公司内部职能部门还有自己的工作，举个例子比如可以外接项目的集团it部门，那么项目经理都是在职能经理管控之下，项目资源由职能经理分配。
根据公司组织架构类型划分 不同的类型决定了关系的不同，比如职能型的，职能经理就是项目经理的上级；项目型，项目经理就是职能经理的上级（少见）；混合型的，两者同级。
项目经理的职权，因所在组织的结构不同而不同，权利小则仅仅充当项目干系人之间的沟通员，权利大则全权负责项目，甚至对项目的人事，资金等有绝对的话语权。