1.Warning: An incorrect timescale is selected for the Verilog Output (.VO) file of this PLL design. It's required that the timescale should be 1 ps when simulating a PLL design in a third party EDA tool.
解决办法：是因为timessale不是1ps导致的错误，原因可能是之前使用过modelSim仿真信号时，将timesacle由默认的1ps改成别的值了，可以点击Assignment--->EDA Tool Setting--->Simulation，将选项中的timescale改成1ps，并点击ok进行保存。如果保存时报错，那么将下面的NativeLink setting下的选项选成None，因为这里是testbench测试脚本对应的设置，如果你没有写测试脚本，那么修改timescale时会检查，所以这里将其制定为None就可以了。
2.Nativelink Error
Error: Can't launch the ModelSim-Altera software -- the path to the location of the executables for the ModelSim-Altera software were not specified or the executables were not found at specified path.
Error: You can specify the path inthe EDA Tool Options page of the Options dialog box or using the Tcl command set_user_option.
Error: NativeLink simulation flow was NOT successful
解决办法：是因为quartusII不知道你安装的modelSim软件的具体路径，所以需要设置ModelSim的具体路径即可。步骤如下（以ModelSim为例，不是ModelSim Altere）：Tools -> Options -> General -> EDA Tool Options：将选项中的ModelSim设为你安装ModelSim的具体路径即可。如下图：
3.关于采用AS下载时提示错误的问题
首先我的芯片信号时EP2Q208C8N芯片，配置芯片型号是EPCS4，在File——Convert File中，电机propery时，不能将compress前面的选项选中，另外在这个选项中，一定要选择正确的配置芯片型号，我之前就因为把PECS4选成了EPC4而消耗半天的时间来查找错误。另外AS进行下载的界面，选中的文件格式是*.pof格式的文件，而Jtag下载的文件时*.sof格式的文件。