此问题研究了将近一个月，最终发现由于JNI不支持C中创建共享内存而导致虚拟机无法识别这块共享内存，造成内存冲突，最终虚拟机崩溃。
注意：JNI的C部分所使用的内存也是由JVM创建并管理的，所以C创建了共享内存，而JVM不知道，产生冲突而崩溃。
解决方法：
1 采用JNI自己的共享内存创建方式（未详细调查）
2 仅通过JNI读取其他C程序（非JNI）创建的共享内存（未调查，应该没问题）
查此问题小技巧：
通过/var/log/message文件查出JVM terminated的问题原因：segfault
通过java dump文件查出具体程序运行细节问题:无法获取shared memory等日志内容
不断注释掉c中各部分代码，最终锁定创建共享内存的代码导致了此问题