一般Windows系统根据引导情况分为两种：BIOS+MBR和UEFI+GPT。
MBR格式硬盘常见于以前的老电脑，它有两个明显的缺点只支持四个主分区和最大只支持2TB硬盘（一说2.2TB，反正有限制就是了），一般常采用3个主分区+1个扩展分区，扩展分区中分出多个逻辑分区，从而实现多分区。如果不是为了安装多操作系统，个人不推荐多分区系统。推荐2~3个分区，多分区造成文件管理比较麻烦。而GPT主分区数量很大，支持的硬盘容量也很大，具体数值待考证（未考证：“GPT对分区数量没有限制，但Windows最大仅支持128个GPT分区。GPT可管理硬盘大小达到了18EB(1EB=1024PB=1,048,576TB)，不过NTFS格式最大仅支持256TB。”）。不足之处是，MBR硬盘的工具比较多，使用的比较多套路都比较熟悉了，GPT硬盘的工具也比较偏少。另外，Windows 7激活利器Windows Loader不支持GPT分区下安装的Windows 7，希望大家支持正版了。
关于系统重装：
MBR和GPT两种模式下，采用微软原版ISO镜像在烧录软件（如UltraISO软碟通）的帮助下，制作光盘或者系统U盘都是没什么问题的。缺点就是U盘烧录之后再做它用里面一堆文件比较乱。我一般不采用这种方式。
第二种就是在硬盘上提取文件什么的。我第一次在32位系统上安装64位系统就是采用这种方式。也比较繁琐，不推荐。
再一种就是直接在原系统下挂载ISO镜像，双击Setup.exe。这种会在C盘添加Windows.old文件夹和启动引导菜单，可以通过磁盘清理解决。缺点是C盘剩余容量不足时可能会失败（？），原系统32位转64位时也不行不通。
我最喜欢的还是用PE系统重装系统：
PE系统可以方便的对磁盘进行整理，比如调整分区，转换硬盘格式（MBR<-->GPT），Ghost（虽然现在也不喜欢用）。PE系统最好是64位，支持UEFI的。最开始是自己制作PE系统，比较麻烦，后来有了exe一键制作PE系统就很方便了。一键PE系统用过老毛桃和大白菜，后来都有广告，不能忍。现在推荐微PE工具箱（wepe）.
MBR格式硬盘用PE基本上可以随便整，安装工具有WIN$MAN.EXE和WinNTSetup.exe，引导修复工具首推DiskGenius。有这几把工具基本上能搞定了。
GPT格式硬盘PE系统首先要选择好，这个鱼龙混杂就要多试试了。啰嗦一句UEFI+GPT格式，需要主板改成UEFI引导，关闭Secure Boot两项就行了。
采用支持UEFI的PE系统安装过程：1.将镜像挂载到虚拟光驱；2.采用WinNTSetup.exe，选择install.vim；3.设置引导驱动器为ESP分区，安装磁盘位置为C盘。4.即可。
还有一种方式，感觉比较奇怪：PE系统在Legacy启动下用WinNTSetup安装器将Windows安装在GPT硬盘，然后进BIOS将启动改成UEFI启动就行了。
WIN$MAN.EXE在GPT下还没试过，应该是可以的。
扩展阅读：关于UEFI启动+GPT分区 的一些经验