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  • 【BZOJ1264】基因匹配(AHOI2006)-DP+树状数组

    测试地址:基因匹配
    做法:本题需要用到DP+树状数组。
    考虑最基本的求LCS的DP,令f(i,j)为以第一个串第i个字符结尾,用第二个串的前j个字符进行匹配,能得到的LCS长度。有以下状态转移方程:
    AiBj时:f(i,j)=f(i,j1)
    Ai=Bj时:f(i,j)=max(f(i,j1),f(k,j1)+1(k<i))
    我们发现f(i,j)f(i,j1)有变化当且仅当存在Ai=Bj,又因为一个字符在字符串中仅出现5次,所以处理每一层时,只用考虑5个位置的变化。而上面的状态转移需要维护前缀最大值和单点往大修改,显然可以用树状数组维护,这样我们就解决了这一题,时间复杂度为O(nlogn)
    以下是本人代码:

    #include <bits/stdc++.h>
    using namespace std;
    int n,pos[20010][6],mx[100010],cnt[20010];
    
    int lowbit(int x)
    {
        return x&(-x);
    }
    
    void modify(int x,int y)
    {
        for(int i=x;i<=5*n;i+=lowbit(i))
            mx[i]=max(mx[i],y);
    }
    
    int query(int x)
    {
        int ans=0;
        for(int i=x;i;i-=lowbit(i))
            ans=max(ans,mx[i]);
        return ans;
    }
    
    int main()
    {
        scanf("%d",&n);
        for(int i=1;i<=5*n;i++)
        {
            int x;
            scanf("%d",&x);
            pos[x][++cnt[x]]=i;
        }
    
        for(int i=1;i<=5*n;i++)
        {
            int x;
            scanf("%d",&x);
            for(int j=5;j>=1;j--)
            {
                int p=pos[x][j];
                modify(p,query(p-1)+1);
            }
        }
    
        printf("%d",query(5*n));
    
        return 0;
    }
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