只需要把input[i].setAttribute('checked',true);改成input[i].checked=true;
input[i].removeAttribute('checked');改成input[i].checked=false;就好了
因为setAttribute设置的是input的attribute属性，也就是对于HTML元素我们自己定义的DOM属性，在处理时，使用attr方法。
而如果在点击全选之前，选中了一个input，但是input这个节点并没有增加checked这个属性，这里没有增加的checked是
attribute属性，在选中这个input的时候，增加的应该是js对象input的property属性，也就是元素本身就带有的固有属性，在处理时，使用prop方法。
所以也可以用jquery中的方法.prop()去修改checked的值,这里的input[i].checked=true;修改的也是js对象input的property属性。
<a href="http://www.baidu.com" target="_self" class="btn">百度</a>
这个例子里<a>元素的DOM属性有“href、target和class"，这些属性就是<a>元素本身就带有的属性，也是W3C标准里就包含有这几个属性，或者说在IDE里能够智能提示出的属性，这些就叫做固有属性。处理这些属性时，建议使用prop方法。
<a href="#" id="link1" action="delete">删除</a>
这个例子里<a>元素的DOM属性有“href、id和action”，很明显，前两个是固有属性，而后面一个“action”属性是我们自己自定义上去的，<a>元素本身是没有这个属性的。这种就是自定义的DOM属性。处理这些属性时，建议使用attr方法。使用prop方法取值和设置属性值时，都会返回undefined值。
<input id="chk1" type="checkbox" />是否可见
<input id="chk2" type="checkbox" checked="checked" />是否可见
像checkbox，radio和select这样的元素，选中属性对应“checked”和“selected”，这些也属于固有属性，因此需要使用prop方法去操作才能获得正确的结果。
$("#chk1").prop("checked") == false
$("#chk2").prop("checked") == true
如果上面使用attr方法，则会出现：
$("#chk1").attr("checked") == undefined
$("#chk2").attr("checked") == "checked"